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ppx523

新虫 (初入文坛)

[求助] 跪求Clustalx汉化绿色版及说明

请问哪位朋友有Clustalx汉化绿色版及说明啊,急用!!!!十分感谢!
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jiaxinfish

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
ppx523: 回帖置顶 2012-02-05 18:41:28
ppx523(金币+2): ★★★★★最佳答案 2012-02-05 18:47:02
用ClustalX做多序列比对分析图示

1、打开程序

如下图所示:


2、Load Sequnce, 载入序列

如下图所示:


3、选择序列文件,FASTA格式的

如下图所示:


4、用文本编辑器察看FASTA序列文件内容,这里用的是记事本,推荐用EditPlus或者Ultraedit

如下图所示:


5、序列Load进去之后

如下图所示:


6、Do Complete Alignment, 通常情况下直接选这个即可,无须修改比对参数

如下图所示:


7、点Do Complete Alignment之后弹出的文件对话框,.dnd的是输出的指导树文件,.aln的是序列比对结果,它们都是纯文本文件

如下图所示:

点“ALIGN”之后开始等待,如果序列不多,很快就可以算完,如果数据很多,可能要等一段时间,这时候可以用眼睛盯着ClustalX的状态栏,那里会有程序运行状态和现在正在比对那两条序列的提示信息,看看可以消磨时间。。。

8、比对结束之后,我们可以看到这个结果

如下图所示:


9、这时候我们可以发现ClustalX已经生成了.dnd和.aln两个文件,仍然用文本编辑器打开来看,这时.aln文件,这个文件可以用Mega2做进一步的bootstrap进化树分析

如下图所示:


10、这是.dnd文件(指导树)

如下图所示:


11、可以用Treeview打开dnd文件,看上去就像这样子

如下图所示:
2楼2012-02-05 13:35:51
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jiaxinfish

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

attatched

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  • 附件 1 : Clustalx的使用.doc
  • 2012-02-05 13:37:12, 218 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2012-02-05 13:37:17
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ppx523

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by jiaxinfish at 2012-02-05 13:37:17:
attatched

好人,看懂了,感谢你的帮助。
4楼2012-02-05 18:45:55
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fangni

新虫 (正式写手)

怎么没有图呀,楼主帮忙解决一下吧
5楼2012-03-26 19:37:14
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lyh0455

木虫 (著名写手)

thanks much !!
6楼2012-06-21 22:30:46
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3Q
7楼2013-04-18 10:43:05
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