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lbambool

木虫 (著名写手)


[资源] 随文献下载的文本格式晶体结构导入到MS的一种方法

今天查文献时下载了三个文本格式的晶体结构文件,尝试多种方法试图导入到MS中一直不成功,多次尝试后发现,这个文本文件可用Diamond打开并存成cif文件,这个cif文件可以导入到MS里,但其中数据会缺失一部分,结构不完整。网上搜索发现也有人说diamond导出的cif不能使用,尝试导出成其他格式也不能直接导入到MS里。后来想起机上装有CCDC,因发文章的作者多半会把结构数据发给CCDC,于是尝试用CCDC组件来处理。
1.先用Diamond打开并存成cif文件;
2.打开Mercury,用它再打开刚才的cif文件,可以看到与用CCDC显示的结果相同,再用Mercury保存成cif文件;
3.用MS导入最后用mercury保存的cif文件可以完美显示晶体结构。

今天整整一个晚上都用来做这件事,小木虫上也查到有人问同样的问题,便把方法整理记录下来,以便网友共享。
应网友要求,加上主要步骤图片,不过较多,放在一个文件里了,需要的自己下载一下吧,一个一个的贴太麻烦了,见谅。[ Last edited by lbambool on 2012-1-29 at 22:45 ]
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  • 2012-01-29 22:44:34, 973 K

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cathelili

新虫 (小有名气)


LZ,你好,想请教一下,你在哪里下到的晶体结构文件,例如我想下这篇文章对应的晶体结构文件,应该在哪呢?http://www.sciencemag.org/content/319/5865/939
非常感谢
66楼2013-06-07 14:50:08
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zhangliang8

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢楼主分享经验!~
2楼2012-01-29 08:53:40
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wo_cow

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

神人呐!!!!!!!!1
8楼2012-02-23 16:44:58
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yalefield4楼
2012-01-30 07:34   回复  
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xuhu_115楼
2012-01-30 18:38   回复  
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2012-01-31 16:14   回复  
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2012-02-17 20:44   回复  
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vasp0019楼
2012-02-25 07:58   回复  
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2012-02-25 09:18   回复  
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huangll9911楼
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truemantwo12楼
2012-02-26 14:11   回复  
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天欲蓝13楼
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