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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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fgwei2000

铜虫 (正式写手)

[求助] Linux环境下批处理问题求教!

本人在做Linux环境下运行程序,由于程序要反复运行,但是程序本身不是并行运算。
做法为:为每一个文件夹中的可执行行程序编写了一个脚本jobscript,单独提交该脚本可以运行相应文件夹下的程序。但是现在需要对100个文件夹中的jobscript进行批处理,似乎我的批处理运行到
cd /home/fgwei2000/run00
qsub jobscript
cd ..
上个这个地方(或类似地方)就不在运行,给出的错误提示为command not found。
请大家帮忙看看我的两个脚本是不是有问题,首先,我确信我的脚本独立脚本文件jobscript是可以启动相应程序的,已经运行过。
所以问题应该在批处理脚本xrun上面。
请大家指教!感激不尽。
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  • 附件 1 : jobscript
  • 2012-01-11 02:30:27, 104 bytes
  • 附件 2 : xrun
  • 2012-01-11 02:30:47, 19.96 K

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lt292

金虫 (正式写手)

Holy Shit

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jjdg(金币+1): 感谢您发表观点 2012-01-12 01:20:13
fgwei2000(金币+2): 2012-01-12 21:37:18
$PATH环境变量问题
你写的脚本不在shell的默认$PATH环境变量文件夹,
把脚本的违者添加到$PATH就可以了
具体的命令忘了
$PATH什么的,google吧
记忆中的颜色,慢慢褪去,变成一缕缕的黑丝,最终消失在茫茫的空白里,一去不返```
2楼2012-01-11 23:35:44
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fgwei2000

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by lt292 at 2012-01-11 23:35:44:
$PATH环境变量问题
你写的脚本不在shell的默认$PATH环境变量文件夹,
把脚本的违者添加到$PATH就可以了
具体的命令忘了
$PATH什么的,google吧

谢谢!我是菜鸟级的Linux用户。才刚接触,只会用一些简单的命令。你说的这个我不会用,能否给我说一下详细我应该怎么改哪一行?谢谢!
3楼2012-01-12 21:36:48
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lurencyj

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
jjdg(金币+1): 感谢参与 2012-02-17 02:00:52
fgwei2000(金币+1): 2012-02-25 22:26:14
楼主说,“给出的错误提示为command not found”

能否给出全部的错误信息呢? 比如

-bash: asdf: command not found
很女子很弓虽大
4楼2012-02-16 20:37:41
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huweny87

木虫 (小有名气)

#!/bin/bash
cd /home/fgwei2000/
for x in run*
do
cd $x
qsub ./jobscript
cd ..
done
少年心事当拏雲,谁念幽寒坐呜呃?
5楼2012-03-21 08:53:17
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huweny87

木虫 (小有名气)

要用./jobscript代替"jobscript",否则系统会认为你输入的jobscript是系统命令,"."代表当前文件夹,"./jobscript"即是当前目录下的jobscript文件
少年心事当拏雲,谁念幽寒坐呜呃?
6楼2012-03-21 08:56:03
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