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Die Arbeitsgruppe Computational Biology an der Universität Erlangen-N¨¹rnberg bietet eine Doktorandenstelle im Bereich des in silico Designs von Proteinen an.

Protein-Protein und Protein-DNA Wechselwirkungen bestimmen eine Vielzahl biologischer Prozesse, z.B. die Erkennung von Antigenen durch Antikörper und die Transkriptionskontrolle in der Zelle. Ein molekulares Verständnis der unterschiedlichen Erkennungsmechanismen ist essentiell f¨¹r Funktionsanalysen oder das Design von Proteinen mit bestimmten Eigenschaften, z.B. f¨¹r das Design von DNA bindenden Proteinen mit veränderter Spezifizität.

Das Ziel des Projektes ist die Entwicklung einer computergest¨¹tzten Methode f¨¹r die Analyse des Effektes von Mutationen auf die Protein-Protein und die Protein-DNA Bindung [1]. Die Methode soll eingesetzt werden in der Identifikation von Schl¨¹sselresiduen f¨¹r die Bindungsstärke und die Spezifizität sowie dem Design von DNA bindenden Proteinen.

[1] A. Benedix et al., Nature Methods 6:3-4, 2009


Die Arbeitsgruppe ist international besetzt, die Schwerpunkte liegen in der Modellierung biologischer Membranen sowie im in silico Design von Protein. Die Teilnahme an internationalen Tagungen ist selbstverständlich, die Möglichkeit zu Auslandsaufenthalten ist gegeben.

Die Bezahlung richtet sich nach E13 (60%).

Voraussetzungen: Master/Diplom in Physik oder Chemie, Interesse an theoretischen Fragestellungen, Computerkenntnisse (Linux, gute Programmierkenntnisse)

Bewerbungen (mit CV) bitte per E-Mail (pdf) an

Prof. Rainer Böckmann
rainer.boeckmann@biologie.uni-erlangen.de


Anfangsdatum: 8. Januar 2012

geschätzte Dauer: 36 Monate

Bezahlung: 60% E13

Homepage: http://www.biotechnik.nat.uni-erlangen.de/research/boeckmann/
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