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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 小麦族物种有哪些基因为单基因？
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farawaylcr

铜虫 (小有名气)

[求助] 小麦族物种有哪些基因为单基因？

有哪些基因为小麦族物种共有的单拷贝基因，又可以用于系统学研究的（比如说不同物种间有单核苷酸或者几个核苷酸的差异）啊？请赐教几个例子啊。。。
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1楼 2011-12-26 09:45:31
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
farawaylcr(金币+5): ★有帮助 2011-12-26 12:51:56
ppd 1 见  郭志爱 2010  new   physiologist
q 基因 2011 pnas
高分子谷蛋白
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真相是最大的奢侈品
2楼2011-12-26 11:41:30
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farawaylcr

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-12-26 11:41:30:
ppd 1 见  郭志爱 2010  new   physiologist
q 基因 2011 pnas
高分子谷蛋白

Q基因在大部分小麦族物种中有，但是像中间偃麦草等这些难脱粒的物种中没有把？
高分子谷蛋白不是多基因家族吗？即同一引物可以扩增出多个不同基因，其扩增产物往往是MIXTURE。
可能我没有表达清楚，不好意思。
我现在有一个多倍体物种，这个多倍体物种中有一个基因组来源不清楚，因此需要用多个可能的二倍体以及其他二倍体对照，如中间偃麦草等物种来确证到底来源于哪个物种，现在想用克隆单拷贝基因的方法来做，最好是所有小麦族物种都能扩出来的那种单拷贝基因哈。
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3楼2011-12-26 12:51:16
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
★ ★ ★
amisking(金币+3): 鼓励发帖交流。 2011-12-26 18:05:56
引用回帖:
3楼: Originally posted by farawaylcr at 2011-12-26 12:51:16:
Q基因在大部分小麦族物种中有，但是像中间偃麦草等这些难脱粒的物种中没有把？
高分子谷蛋白不是多基因家族吗？即同一引物可以扩增出多个不同基因，其扩增产物往往是MIXTURE。
可能我没有表达清楚，不好意思。 ...

Glu D1 AS-PCR 可以括增单个位点
Q基因有 Q 与 q 基因之分，2011年pnas上有这个区分，q 具有spleto野生性状
小麦克隆的基因不多
6倍体小麦 基因至少都有 abd 3个拷贝 因此引物设计要特异，这样比较方便测序分析
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真相是最大的奢侈品
4楼2011-12-26 14:20:05
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chenguestc

木虫 (职业作家)
★ ★ ★
wanhscn(金币+3): 鼓励交流！ 2011-12-27 16:03:14
nuclear genes DMC1 and EF-G
plastid genes rbcL and ndhF
low-copy nuclear genes: phosphoenolpyruvate carboxylase, beta-amylase, and granule-bound starch synthase I et al.
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5楼2011-12-27 14:54:47
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
引用回帖:
5楼: Originally posted by chenguestc at 2011-12-27 14:54:47:
nuclear genes DMC1 and EF-G
plastid genes rbcL and ndhF
low-copy nuclear genes: phosphoenolpyruvate carboxylase, beta-amylase, and granule-bound starch synthase I et al.

这些基因的保守性如何？
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真相是最大的奢侈品
6楼2011-12-27 15:41:50
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
wanhscn(金币+5, MolEPI+1): Good！授予专家指数！ 2011-12-27 16:23:16
引用回帖:
6楼: Originally posted by wanhscn at 2011-12-27 15:41:50:
这些基因的保守性如何？

这些基因都比较保守，都已经被用于系统学研究了。SUN GENLOU的论文里，ROBERTA J. MASON-GAMER的论文里，都有被经常用。
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7楼2011-12-27 16:18:10
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
引用回帖:
7楼: Originally posted by chenguestc at 2011-12-27 16:18:10:
这些基因都比较保守，都已经被用于系统学研究了。SUN GENLOU的论文里，ROBERTA J. MASON-GAMER的论文里，都有被经常用。

高保守性对研究整个小麦族还是合适的。
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真相是最大的奢侈品
8楼2011-12-27 16:22:51
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farawaylcr

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by chenguestc at 2011-12-27 14:54:47:
nuclear genes DMC1 and EF-G
plastid genes rbcL and ndhF
low-copy nuclear genes: phosphoenolpyruvate carboxylase, beta-amylase, and granule-bound starch synthase I et al.

非常感谢。。。。。
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9楼2011-12-28 13:09:04
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
引用回帖:
9楼: Originally posted by farawaylcr at 2011-12-28 13:09:04:
非常感谢。。。。。

不过，楼主还是要注意，在小麦族中克隆基因还是不太容易的，一般基因在多倍体物种中有多个单拷贝，保守性太高，第一，不能区分不同亚基因组上的单基因，第二，高保守性对研究狭窄区域内进化问题还是不得力的。
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真相是最大的奢侈品
10楼2011-12-28 13:26:06
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