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ryxiao

禁虫 (小有名气)
送鲜花一朵
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11楼2011-12-28 08:14:10
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
引用回帖:
11楼: Originally posted by ryxiao at 2011-12-28 08:14:10:
你好，我用noeigen的经验是有时候成功有时失败，每次失败的都是优化到非反应方向上了，那是不是说明我的开始构形离真正ts很远？有什么办法使开始的构形和真正ts离得不是那么远吗？
谢谢

是的，说明你输入的猜测结构不对。
至于怎么猜得差不多，还是要从反应机理上入手。
不太精确的比喻，过渡态就是某个键将断未断，另一个键将成未成的那个中间的瞬间，正反两方势均力敌的时刻。如果预定要断的那个键能量高，要成的键能量低，则过渡态偏向于要断的键拉得长一些，比如拉成1.6倍，要成的键拉得短一些，比如1.3倍。让二者尽量势均力敌些。中间体偏向于产物多一些。同时考虑断键过程中的空位位阻减小，而成键过程空间位阻增加，周围的基团适当旋转开，让出一些空间来。
反之亦然。这个找感觉吧，呵呵。。当然，如果是简单的迁移过程，比如显然过渡态就是个键角或者二面角的的变化，那可以直接先做个简单的硬扫描，用能量最高点做初始猜测就行。
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
12楼2011-12-28 12:00:25
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