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lybra

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何做径向分布函数和长程序LRO?

有坐标文件,如何做径向分布函数和长程序LRO?
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sdzjc1988

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
径向分布函数可以用compute RDF命令进行计算,让LAMMPS输出结果写入一个文件,比如RDF.txt什么的,然后选取一定的时间进行计算,文件的最后一个snapshot会对所有结果取平均,建议你用最后一组结果就可以了,把结果放入Origin等画图工具就可以画出结果了。
4楼2012-03-13 11:34:12
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-23 13:49:14
分子模拟与实践这本书有关于径向分布函数的例程,建议你看一下,还挺简单的
壁立万仞,无欲则刚
2楼2011-12-23 12:38:32
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麒麟半仙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
径向分布函数在Exell这种软件下就可以处理,很简单的,理解一下就可以做了。我就是在Exell里处理数据的。
神啊,让我成仙吧。
3楼2012-03-05 13:10:24
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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sdzjc1988 at 2012-03-13 11:34:12
径向分布函数可以用compute RDF命令进行计算,让LAMMPS输出结果写入一个文件,比如RDF.txt什么的,然后选取一定的时间进行计算,文件的最后一个snapshot会对所有结果取平均,建议你用最后一组结果就可以了,把结果放 ...

我是一个新手,现在正在研究lammps的rdf输出,这部分能不能在说的细一些呢?
5楼2012-12-11 19:49:53
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