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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » grompp出错
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xinji

铜虫 (小有名气)

[求助] grompp出错

运行grompp时，出错：
Atoms in the .top are not numbered consecutively from 1 (rather, atomnr = 1, while at->nr = 15)
求解。。。。。
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心若在，梦就在！
1楼 2011-12-20 01:07:39
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明月照清渠

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-12-07 10:21:12
嗯，top文件有问题，把序号改成1~~
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3楼2012-12-07 10:09:44
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0419xuhao

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-12-21 18:48:03
好像top文件有问题，仔细核对下吧
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2楼2011-12-21 11:13:06
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Real-wj

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 明月照清渠 at 2012-12-07 10:09:44
嗯，top文件有问题，把序号改成1~~

我也遇到了同样的问题，请问具体是哪个地方的序号需要改成1呢？
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4楼2018-03-18 11:37:24
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Real-wj

新虫 (初入文坛)
请问你的问题解决了吗？可以分享下是如何解决的吗？我是刚学gromacs的新手，还请多指教~
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5楼2018-03-20 14:17:12
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