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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 引物设计

这两对引物的合成序列应该是一样的吧？
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1楼 2011-12-19 10:52:10
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5xiaosh

银虫 (小有名气)
★
joan198108(金币+1):谢谢参与
看上去不一样
(-_-)zzz
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2楼2011-12-19 12:21:25
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沾欢欢

金虫 (正式写手)
★
joan198108(金币+1):谢谢参与
我觉得一样~
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3楼2011-12-19 12:57:24
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rintor

铜虫 (初入文坛)
★
joan198108(金币+1):谢谢参与
两对引物的序列是不一样的， 但最后扩增出来的目的基因是一样的。
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4楼2011-12-19 16:25:35
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
不一样，但是互补，除非序列是对称的！
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5楼2011-12-19 16:36:06
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by wanhscn at 2011-12-19 16:36:06:
不一样，但是互补，除非序列是对称的！

有点迷糊，请指教
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6楼2011-12-19 19:00:48
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xhy0016

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+2): 耐心回答，辛苦了~ 2011-12-21 19:02:05
很明显不一样啊。比如第一个图的正向引物，如果扩增的是上面那条链的话，引物序列跟上链互补，跟下链相同；而第二个图的正向引物，扩增的是下面那条链，所以，应该与下链互补，上链相同。反向引物同理。引物设计的话，还有很多注意事项，有专门的软件
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7楼2011-12-19 19:17:12
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小小亚杰

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
不一样，但是都能P出同样的条带。
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9楼2011-12-19 23:57:25
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piaoyunokok

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
应该一样的吧。引物肯定是5-3的，只不过下面两条链，反过来就是上面的了。呵呵
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10楼2011-12-19 23:58:45
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shaquila

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+2): Good！ 2011-12-21 19:02:30
不一样，两个片段的三五末端顺序颠倒。就是reverse的结构，而不是reverse complement
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joan198108
11楼2011-12-20 01:01:29
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by shaquila at 2011-12-20 01:01:29:
不一样，两个片段的三五末端顺序颠倒。就是reverse的结构，而不是reverse complement

还是没弄明白，能不能麻烦你图示一下，谢谢！！！
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12楼2011-12-20 08:56:06
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shaquila

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by joan198108 at 2011-12-20 08:56:06:
还是没弄明白，能不能麻烦你图示一下，谢谢！！！

应该是这样吧


[ Last edited by shaquila on 2011-12-20 at 09:46 ]
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13楼2011-12-20 09:41:22
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MAPK

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
应该是一样的，DNA合成只能是5‘——3’
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14楼2011-12-21 09:38:56
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by MAPK at 2011-12-21 09:38:56:
应该是一样的，DNA合成只能是5‘——3’

仔细想了一下，上面那对引物应该不能成功扩增，如同你所述，3‘-5’不能延伸
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15楼2011-12-21 10:55:29
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by shaquila at 2011-12-20 09:41:22:
应该是这样吧

[ Last edited by shaquila on 2011-12-20 at 09:46 ]

上面那对引物应该是不能延伸的，因为产物是3‘-5’，这样聚合酶就没有延伸能力吧，不知道我说的对吗
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16楼2011-12-21 10:56:56
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shaquila

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
又没有规定上面一定是五到三
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17楼2011-12-21 11:32:55
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coh2lxx

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
学习了。一直都不怎么会设计引物。
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18楼2011-12-21 11:58:37
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by shaquila at 2011-12-21 11:32:55:
又没有规定上面一定是五到三

由于聚合酶的延伸方向是5‘-3’，所以第一对引物应该不能合成产物
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19楼2011-12-23 14:02:34
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shaquila

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by joan198108 at 2011-12-23 14:02:34:
由于聚合酶的延伸方向是5‘-3’，所以第一对引物应该不能合成产物

上面一条未必是5－3，下面一条未必是3-5
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20楼2011-12-23 14:19:33
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sean-u

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
一样的，如果你要互补链，软件里改下就好了
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21楼2011-12-23 18:23:11
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piaoyunokok8楼
2011-12-19 23:57   回复  
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