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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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joan198108

超级版主

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[交流] 引物设计

这两对引物的合成序列应该是一样的吧?
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5xiaosh

实习版主

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joan198108(金币+1):谢谢参与
看上去不一样
(-_-)zzz
2楼2011-12-19 12:21:25
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沾欢欢

实习版主

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joan198108(金币+1):谢谢参与
我觉得一样~
3楼2011-12-19 12:57:24
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rintor

主管区长

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joan198108(金币+1):谢谢参与
两对引物的序列是不一样的, 但最后扩增出来的目的基因是一样的。
4楼2011-12-19 16:25:35
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wanhscn

兑换贵宾

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
不一样,但是互补,除非序列是对称的!
5楼2011-12-19 16:36:06
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joan198108

管理员

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引用回帖:
: Originally posted by wanhscn at 2011-12-19 16:36:06:
不一样,但是互补,除非序列是对称的!

有点迷糊,请指教
6楼2011-12-19 19:00:48
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xhy0016

实习版主

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★ ★ ★
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西瓜(金币+2): 耐心回答,辛苦了~ 2011-12-21 19:02:05
很明显不一样啊。比如第一个图的正向引物,如果扩增的是上面那条链的话,引物序列跟上链互补,跟下链相同;而第二个图的正向引物,扩增的是下面那条链,所以,应该与下链互补,上链相同。反向引物同理。引物设计的话,还有很多注意事项,有专门的软件
7楼2011-12-19 19:17:12
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小小亚杰

超级版主

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
不一样,但是都能P出同样的条带。
9楼2011-12-19 23:57:25
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piaoyunokok

主管区长

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
应该一样的吧。引物肯定是5-3的,只不过下面两条链,反过来就是上面的了。呵呵
10楼2011-12-19 23:58:45
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shaquila

主管区长

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★ ★ ★
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西瓜(金币+2): Good! 2011-12-21 19:02:30
不一样,两个片段的三五末端顺序颠倒。就是reverse的结构,而不是reverse complement

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

11楼2011-12-20 01:01:29
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joan198108

版主

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送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by shaquila at 2011-12-20 01:01:29:
不一样,两个片段的三五末端顺序颠倒。就是reverse的结构,而不是reverse complement

还是没弄明白,能不能麻烦你图示一下,谢谢!!!
12楼2011-12-20 08:56:06
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shaquila

主管区长

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引用回帖:
12楼: Originally posted by joan198108 at 2011-12-20 08:56:06:
还是没弄明白,能不能麻烦你图示一下,谢谢!!!

应该是这样吧


[ Last edited by shaquila on 2011-12-20 at 09:46 ]
13楼2011-12-20 09:41:22
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MAPK

实习版主

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应该是一样的,DNA合成只能是5‘——3’
14楼2011-12-21 09:38:56
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joan198108

实习版主

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引用回帖:
: Originally posted by MAPK at 2011-12-21 09:38:56:
应该是一样的,DNA合成只能是5‘——3’

仔细想了一下,上面那对引物应该不能成功扩增,如同你所述,3‘-5’不能延伸
15楼2011-12-21 10:55:29
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joan198108

兑换贵宾

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引用回帖:
: Originally posted by shaquila at 2011-12-20 09:41:22:
应该是这样吧

[ Last edited by shaquila on 2011-12-20 at 09:46 ]

上面那对引物应该是不能延伸的,因为产物是3‘-5’,这样聚合酶就没有延伸能力吧,不知道我说的对吗
16楼2011-12-21 10:56:56
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shaquila

专家顾问

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!



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又没有规定上面一定是五到三
17楼2011-12-21 11:32:55
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coh2lxx

实习版主

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学习了。一直都不怎么会设计引物。
18楼2011-12-21 11:58:37
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joan198108

管理员

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引用回帖:
: Originally posted by shaquila at 2011-12-21 11:32:55:
又没有规定上面一定是五到三

由于聚合酶的延伸方向是5‘-3’,所以第一对引物应该不能合成产物
19楼2011-12-23 14:02:34
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shaquila

主管区长

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by joan198108 at 2011-12-23 14:02:34:
由于聚合酶的延伸方向是5‘-3’,所以第一对引物应该不能合成产物

上面一条未必是5-3,下面一条未必是3-5
20楼2011-12-23 14:19:33
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sean-u

专家顾问

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一样的,如果你要互补链,软件里改下就好了
21楼2011-12-23 18:23:11
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简单回复
2011-12-19 23:57   回复  
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