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PubMed完全攻略
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PubMed完全攻略 第一章 进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福， 我们那时候要查一篇 相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做 的课题时，要 搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。" 趁他打顿的时候，我 告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后 面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工 作者来说，我 已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息 量，使用的方 便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要 的一点，正如 它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开 放的。无论何 时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ pubmed/就可 以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属 的国家生物技术 信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生 研究院（NIH） 的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有 必要每次使用P ubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部 分全文。其覆 盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经 足够早了，很 少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能 是个例外。而 最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提 供最新的文献 摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章 从被期刊接受 到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握 最新的动向， 从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文 献的全文，有 时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城 "的感觉了（关于如 何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed的主界面后， 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框 和功能键（如 下图）。 这是PubMed的核心部分。大部分工作，我们只要利用这"一框五 键"（检索框，Limit 键, Preview/Index键, History键，Clipboard键和Details键）即可完成 。 在主界面的左侧框（如左图），有： · Journal Browser 期刊浏览 · Journal Browser 期刊浏览 · MeSh Browser可以用它来分层流览MeSH表 · Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整 个期刊的内容 。 · Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多 篇文献。 · Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的 文献固定在4 个范围：治疗、诊断、病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式) 3) Related Resources · Order Documents可以使用户在当地得到文献的全文， 但这是要收费的 ，至于如何免 费获得文献全文，我将在后面的有关章节中详述。 · Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。Grateful M ed也提供MEDLI NE的接入，并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。 · Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接，MEDLINEplus是与消费者 健康信息相关 的国家医学图书馆的网络节点。 · Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。 利用左侧框的这些服务，我们不仅能够进行功能更加强大的检索，而且还 能得到不少非 常有用的服务。这些都将在后续章节中介绍。 总体而言，PubMed的界面相当简洁清晰，几乎是傻瓜式的。 然而傻瓜式的界面并不意味着傻瓜式的操作。我看到很多人用了几年的 PubMed，还是 只知道在检索框里输入一个关键字，然后按一下"Go"按钮这样 一种单一原始的检索方式 总体而言，PubMed的界面相当简洁清晰，几乎是傻瓜式的。 。虽然有一半左右的情况，这样的操作就足以得到令人满意的信息，但对 于另一半情况 ，就没有那么幸运了，要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的&quo t;无用"信息中，要 么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人费解的是，很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间， 却不愿花上几 个小时的时间去认真研究一下PubMed。"君欲善其事，必先利其器&q uot;， PubMed就好像一把 功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重 要的是，你要 知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。 在以后的章节中，我们将逐步深入地了解PubMed，相信通过这些章节的 学习，我们可 以真正熟练掌握PubMed，从而使自己的工作事半功倍。 第二章 PUBMED简单检索技巧 一．在这一章里，我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献，作以 简单介绍。 1．当你打开浏览器，在地址栏内键入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ PubMed/或是h ttp://www.PubMed.gov/后，就进入了PUBMED检索系统主页,可以见到如下 的页面。 2．在靠近页面上部的地方，首先映入我们眼帘的，即是供我们输入所 需查询内容的 检索框。 在检索框中输入查询词，然后单击"go"按钮或按回车键，P ubMed将会自动开始检索， 并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面，你还可以选定所要 检索内容的数 据库范围，除NCBI的数据库以外，可供选择的还有：PROTEIN, STRUCTURE , POPSET等等 。 说到这里，很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符然后回车一敲 便可万事大吉 ，其实不然。每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下 建议仅供读者 参考： ? 明确你索要检索的关键概念及词语，即关键字； ? 考虑到关键字的类似说法，即有可能出现的同义词； ? 考虑到关键字的类似说法，即有可能出现的同义词； ? 通过限定DATES, STUDY GROUP等，精炼你的检索范围； ? 多向有经验的人求教，因为不同的专业背景以及个人的差异，都有 可能形成不同 的方法和技巧。 3．通过布尔（BOOLEAN）运算来提高你的效率 最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。 ? AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪 ，只要他们都 出现在索引文章的某一处，就将其列出。 ? 而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出，这种运算在想将相似 主题的文章罗 列在一起时，十分有效。 ? NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使 用的时候要特 别注意，会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时，除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章，同时也会删去那 些同时讨论儿 童及其他年龄组的文章。 4．PUBMED检索类型 通常我们所要查询的单词类型大致可以分为： ? 词语（主题）检索 这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文 单词或短语（ 大写或小写均可）。然后回车或点击"Go"， PubMed即使用其词 汇自动转换功能进行检索 ，并将检索结果直接显示在主页下方。例如：键入"vitamin c comm on cold"后回车或点 击"Go"， PubMed开始检索并将检索结果显示出来。 ? 著者检索 当我们所要查询的是著作者时， 在检索框中键入著者姓 氏全称和名字 的首字母缩写，格式为："著者姓 空格 名字首字母缩写"，例 如smith ja，然后回车或 点击Go，系统会自动到著者字段去检索，并显示检索结果。 ? 刊名检索 在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号 ，例如：molec ular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524，然后回车 或点击Go,系统 将在刊名字段检索，并显示检索结果。 ? 日期或日期范围检索 可以在检索框中键入日期或日期范围，然后回 车或点击Go， 系统会按日期段检索，并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为 YYYY/MM/DD； 如：1999/09/08 也可以不录月份和日子，如：2000或1999/12。 ? 检索期刊子集（辑） 检索的格式为：检索词AND jsubseta,如：ne oplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种：Abridged Index Medicus(有120种 重要核心期刊 )、Dental和Nursing。分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定 。 ? 检索带文摘的记录 检索的格式为：检索词AND has abstract, 如： liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLI NE记录中没有 文摘。 ? 布尔逻辑检索 PubMed系统允许使用布尔逻辑检索，只要在检索框中 键入布尔逻辑 运算符（AND，OR或NOT）。具体使用时要注意的问题，详见上第3点所述。 5．如何处理检索结果 当你点击GO或回车后，PubMed将会自动运行检索命令，在屏幕的下方 显示出符合检 索要求的项目，并且在查询框内保留原检索词。此时要注意的是符合检索 要求的项目是 以SUMMARY（简要格式）显示出来的，就是列出作者，文章题目，以及文章 来源的一些信 息。 在DISPLAY键后还可以选择别的显示格式，点击DISPLAY键后，系统按 所选格式全部 检索结果。 如果只需要显示其中一部分记录，则需点击该记录左边的查询框，使 标记后，再点 击Display键；如果只需显示一条记录，则可直接点击该记录中的作者姓名 超链接，系统 会自动显示该记录的文摘格式。 还有一点，系统所设定的默认值为每页显示20条选项，这点可以在SH OW后的下拉菜 单处选择。 如果选中所感兴趣的内容，即可进行保存，打印等等操作。PubMed系 统允许最多可 保存5000条记录。要保存全部检索结果时，打开Summary下拉菜单选择其中 一种格式，然 后点击Save键；要保存特定记录时，点击记录左边的选择框予以标记后， 再点击Save键 。 使用浏览器的打印功能，即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每 页最多显示500 条记录。如果想打印成文本格式，请先点击Text键，然后再打印。 下一章我们将用几个实例来使大家熟悉以上检索技巧。 |
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http://www.herceptin.com.cn/index1_31.htm进入这个网站就行了!上面有讲得!我还有视频教怎么查!可以联系我! 楼主!虽然你是抄的,还是可佳哈!不过网站上有图片!更好三 [ Last edited by maosen820705 on 2007-2-21 at 00:15 ] |
7楼2007-02-21 00:11:32
