24小时热门版块排行榜    

查看: 2735  |  回复: 1

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] GOLD对接,得分是越高越好还是越低越好

请教,GOLD对接打分的时候,chemscore打分是正的10左右,和文献报道的配体位置较相近。请问正常吗? 我以前对接的(不成功)打分基本上都是负数。
GOLDscore打分是越正越好,chemscore表示的是能量,一般表示能量不都是越负越好吗? 有点糊涂
另外,请教,其他几个函数的打分也是越正越好吗?谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
cfmzxf84(金币+8): ★★★很有帮助 我也是做的redock,打分波动蛮大的,同样的运算,最高的一次也才26,是不是参数没设置好呢? 谢谢 2011-12-21 16:33:38
御剑江湖(金币+1): 楼主已奖励,同样谢谢 2011-12-21 18:42:20
GOLD对接Chemscore打分过去我晶体结构中的配体分子Redock做RMSD,好的构象打分都是40多到50多都有,虚筛的分子打分我都选高分的,不会是负值的
2楼2011-12-21 15:35:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cfmzxf84 的主题更新
信息提示
请填处理意见