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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » ME/Gulp » MS中Gulp模块下原子如何固定
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liwl926

金虫 (正式写手)
送红花一朵
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10楼: Originally posted by li_jinchun at 2015-10-07 15:03:02
我不太清楚“相连并固定”是为了什么，但是这种比较难实现，如果一定要这样算，我建议用简单的分子动力学程序去算。或者gulp中你可以把势修改。或者把原子标记改变，就是只考虑分子之间相互作用，不考虑分子内部相 ...

我希望把原子标记改变，就只考虑分子之间相互作用，不考虑分子内部相互作用。如何实现呢？求助！
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11楼2015-10-08 13:55:58
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li_jinchun

金虫 (小有名气)
比如氧原子，O，在gulp中默认为O1。如果是分子内的氧，可以用O1，另一个分子内氧分子用O2，以此类推。那么定义原子势的时候，分别定义O1-O1,O2-O2,O2-O1。这样两个分子内氧原子相互作用，以及分子之间作用也确定。

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12楼2015-10-08 19:52:04
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li_jinchun

金虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by liwl926 at 2015-10-08 13:55:58
我希望把原子标记改变，就只考虑分子之间相互作用，不考虑分子内部相互作用。如何实现呢？求助！...

比如氧原子，O，在gulp中默认为O1。如果是分子内的氧，可以用O1，另一个分子内氧分子用O2，以此类推。那么定义原子势的时候，分别定义O1-O1,O2-O2,O2-O1。这样两个分子内氧原子相互作用，以及分子之间作用也确定

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13楼2015-10-12 08:06:54
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