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服务器上用discover计算慢的问题，并行更慢的问题
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现在遇到了一些问题，希望大牛们，高手们能百忙之中帮我看一下： 1、在inux下计算的时候不并行默认的是一个cpu是吧？我的服务器都是2G的cpu，小的服务器一般4个cpu，大的有8个cpu。 2、用linux下一个cpu也应该比我在win下计算快一些吧，可是比我电脑慢，我win电脑配置：见下图 3、当我在服务器上选择4个cpu使用并行的时候，同样的输入文件（18648个原子），在我win电脑上计算用了11个多小时，而在linux下一天多都没算完，我觉得很奇怪，下面是我提交到服务器上并行开始计算top查看后的情况，有人说这是正常在计算，但是我算了11个小时都没有出来结果，而且显示还在计算，想问问这样真的是调用到了并行吗？是不是显示和实际不同步哦，还有，我的服务器开启了超线程的，那个不是很影响吧，有人说建议关掉，对计算没啥用，而且可能导致内存不够，但是我开机时在bios里面的adavanced里面没有找到hyper threading这个选项，不知道大牛们有没有遇到过类似情况，这个linux下运行慢的问题 服务器的配置：cpu是4个核，详细见一下： -bash-3.2$ cat /proc/cpuinfo processor : 0 vendor_id : GenuineIntel cpu family : 6 model : 23 model name : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU Q9550 @ 2.83GHz stepping : 10 cpu MHz : 2833.018 cache size : 6144 KB physical id : 0 siblings : 4 core id : 0 cpu cores : 4 fpu : yes fpu_exception : yes cpuid level : 13 wp : yes flags : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm bogomips : 5669.61 clflush size : 64 cache_alignment : 64 address sizes : 36 bits physical, 48 bits virtual power management: processor : 1 vendor_id : GenuineIntel cpu family : 6 model : 23 model name : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU Q9550 @ 2.83GHz stepping : 10 cpu MHz : 2833.018 cache size : 6144 KB physical id : 0 siblings : 4 core id : 1 cpu cores : 4 fpu : yes fpu_exception : yes cpuid level : 13 wp : yes flags : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm bogomips : 5666.01 clflush size : 64 cache_alignment : 64 address sizes : 36 bits physical, 48 bits virtual power management: processor : 2 vendor_id : GenuineIntel cpu family : 6 model : 23 model name : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU Q9550 @ 2.83GHz stepping : 10 cpu MHz : 2833.018 cache size : 6144 KB physical id : 0 siblings : 4 core id : 2 cpu cores : 4 fpu : yes fpu_exception : yes cpuid level : 13 wp : yes flags : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm bogomips : 5665.97 clflush size : 64 cache_alignment : 64 address sizes : 36 bits physical, 48 bits virtual power management: processor : 3 vendor_id : GenuineIntel cpu family : 6 model : 23 model name : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU Q9550 @ 2.83GHz stepping : 10 cpu MHz : 2833.018 cache size : 6144 KB physical id : 0 siblings : 4 core id : 3 cpu cores : 4 fpu : yes fpu_exception : yes cpuid level : 13 wp : yes flags : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm bogomips : 5666.05 clflush size : 64 cache_alignment : 64 address sizes : 36 bits physical, 48 bits virtual power management:   |
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自己先顶一下 2楼2011-12-09 11:42:17
