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铁虫 (小有名气)

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[求助] CodeLink基因芯片

请问有谁用过CodeLink系列基因芯片啊？效果怎么样？

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每个人一辈子从来都是一个人

1楼 2011-11-28 15:03:49

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小麦0467

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

我没用过，最近也在找芯片方面的信息，
希望这个对你有参考
Applied Microarrays, Inc.（简称：AMI）从事高密度生物芯片的研发与生产，公司位于美国亚利桑那州立大学科技园内，学术氛围浓厚，同时云集了众多杰出科学家及经验丰富的研发人员，为客户提供优质稳定的各类生物芯片。AMI目前专注于芯片研发及OEM生产，获得了较好口碑。产品线中CodeLink高密度芯片最先在Motorola公司生物部研制并命名；2002-2004年Amersham BioSciences在其基础上开发了人类、大鼠、小鼠全基因组表达芯片，2006年GE公司收购了该生产线，对三类芯片的内容和性能进行优化，同时还增加了定制芯片服务，并着手蛋白芯片的研发。2007年，创始团队AMI从GE公司获得CodeLink产品的所有产权，重新接管CodeLink产品线的研制、生产和销售工作。
CodeLinkTM 芯片同样采用压电点样技术，将预先合成并经过功能验证的寡核苷酸探针点样到特殊的3-D凝胶基质上。该平台的检测灵敏度高达每个细胞一个转录物，并且最低可以检测到 1.3 倍的表达变化，统计学可信度达到 95% 。

芯片质量控制协会(MAQC) 对CodeLink 芯片的评估结果
• CodeLink有最高水平的检测灵敏度
• CodeLink平台比其他芯片平台能检测到的基因多30%
• CodeLink检测的低表达基因数比其他商业化芯片平台多60%
• CodeLink能检测到50fM（1fM =10-15Mol）浓度的转录物
• CodeLinkTM基因表达芯片系统包括：预先合成并点样的高质量寡核苷酸芯片；靶标物制备及芯片处理试剂；便于用户使用的操作工具包；数据处理软件及优化的操作方案。目前可以提供的芯片种类有人类、大鼠和小鼠全基因组检测的基因表达检测芯片。
CodeLink全基因组芯片
芯片人小鼠大鼠
类型 1-well 1-well 1-well
探针数 54,841 35,587（总）
34,967（特异序列） 33,849
转录本数 57,347 36,142 32,590
阳性对照 360 300 240
阴性对照 384 320 256
RNA进样量 0.2-2 μg 总RNA 0.2-2 μg 总RNA
10μg cRNA 0.2-2 μg 总RNA
10μg cRNA
分析类型单色分析系统单色分析系统单色分析系统
• 特点
1. 单色荧光标记，获得高度重复性、有意义的结果
2. 标记方法和定量软件易学易用
3. 样品需要量小（小于1ug总RNA）
4. 一次可得到上万基因表达数据
5. 高灵敏度，能够检测更多低丰度的转录物（＜0.3 拷贝/细胞）
6. 宽动力学范围，获得更有价值和准确的数据
7. 高特异性，确保对高度同源性基因更好的辨别能力
8. 高度信号重现性，能给出可重复的差异表达结果

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2楼2012-04-25 09:49:41

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