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【其他】CA on CD 数据库简介及检索方法
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一、数据库简介 美国化学文摘历来是化学工作者检索文献、获取信息的主要工具,内容涉及生物化学、无机化学、分析化学、应用化学、化学工程、大分子化学、有机化学等,是世界公认的最有代表性和权威性的化学文献数据库。它的特点是资料覆盖面广,内容齐全,且有多种索引,因而使用十分方便。,医药领域是其中的重要部分,无论是化合物(各种来源的原料药)的制备、分析、制剂、生理活性研究,乃至设备仪器的信息无不包含其中。随着时间的推移和资料的积累,凭借手工方法查阅印刷版的化学文摘,工作效率已不能令人满意。 CA on CD由美国化学学会(ACS)下属部门美国化学文摘社(CAS)编缉出版,内容对应于印刷版《化学文摘》,每月更新,提供了高效便捷的检索途径。收录了世界上约8000种科技期刊以及31个国家和地区的专利,年文献量约70万篇。其中74%为期刊论文,16%为专利文献,6%为会议论文,2%为学位论文,技术报告和图书各占1%。期刊文献中82.5%为英文文献,中文文献占5.9%。专利文献中54.5%为日本专利,9.7%为美国专利,中国专利占0.9%。现有第1013次累积索引及文摘光盘,包括了19771996年的所有数据,第14次累积索引及文摘光盘将于2002年出版。 CA on CD的出版使研究人员查阅文献更为方便,研究人员查文献的手段由此发生了根本性变化,同时也使得计算机情报检索真正面向每一科研人员。CA on CD必将成为医药工作者获取文献信息的主要工具之一, 二、检索方法 1.CA on CD数据库界面 CA on CD最新版本的软件是在WINDOWS环境下运行的下拉式菜单的软件,操作非常简单方便,熟悉WINDOWS操作的用户,顺着软件的屏幕提示,即可进行检索。 进入数据库后,屏幕会显示CA on CD的首页画面(如上图)。请注意画面上工具条上的图标,这里有五个图标: Browse(浏览) Search(检索) Subst(化合物检索) Form(分子式检索) Help(帮助) 可根据不同的检索要求采用相应的检索方式,只需点击工具条上相应的按钮,按照屏幕的提示检索文献。具体操作如下。 2.CA on CD的基本操作 CA on CD 提供四种基本检索途径:索引浏览式检索(Index Browse) 词条检索(Word Search) 化学物质分级名称检索(Substance Hierarchy) 分子式检索(Formula) 分别依次对应以上所介绍的工具条上一至四图标按钮,以下依次介绍各途径的操作方法。 2.1 索引浏览式检索(Browse键) 所谓浏览式检索是屏幕窗口按数字字母顺序显示指定的检索项的术语清单,可用拉动滚动条到需要的术语处,双击鼠标或点击【Search】按钮。 2.1.1在检索菜单窗口,用鼠标点击 命令,或在“Search”命令菜单中选择“Index Browse”命令,即可进入索引浏览检索页面。 窗口中“Index”字段的缺省值为Word。用户可点击索引框中的下拉式菜单进行选择。 检索项包括:Word(自由词,包括出现在文献题目、文摘、关键词表、普通主题等中所有可检索词汇)、CAS RN(CAS登记号)、Author(作者及发明者姓名)、General Subject(普通主题)、Patent Number(专利号)、Formula(分子式)、Compound(化合物名称)、CAN(CA文摘号)、Organization(组织机构、团体作者、专利局)、Journal(刊物名称)、Language(原始文献的语种)、Year(文摘出版年份)、Document Type(文献类型)、CA Section(CA分类)、Update(文献更新时间或书本式《CA》的卷、期号。) 2.1.2 “Find”对话框用于输入检索术语的前缀,目的是加快拖拉时的定位。 2.1.3 点击【Search】键或按【Enter】键,开始检索。 如:我们欲查有关抗致变作用的文献,在“Index”菜单选择“Gen.Subj”项,并在“Find”框输入“mutation”,再从显示的清单选择“mutation inhibitors”,单击【Search】可出现检索的中间结果,如下图。检索者可在此判断哪些文章是需要的。 在上图中我们看到有许多图标被释放,成为实图标。 Print 打印检索中间结果 Save 把检索中间结果存入文件 Mark 用于对感兴趣文献做标记,以待下一步的存储和打印 Mark All 对所有中间结果做标记,以待下一步的存储和打印 Unmark 撤消标记 Print MK 打印标记过的文献全记录 Save MK 把标记过的文献全记录储存于文件中 DDS MK 把标记过的记录以标准的CASDDS原文索取格式储存 Clear 清屏 在上图中的文献标题处双击鼠标即可得到一条CA的全记录,如下图,此时的“Next”和“Prev”按钮用于翻页浏览下一记录或前一记录。 2.2 词条检索(Search键) 点击 命令按钮,可采用布尔逻辑组配方式将检索词、词组、数据、专利号等限定条件结合起来进行检索,从而提高了检索准确程度。这是CA on CD检索的主要途径,详细的操作技巧可见实例介绍。 2.2.1 点击【Search】命令按钮或在“Search”命令菜单中选择“Word Search”命令,出现如下界面: 2.2.2 在屏幕中部的检索词输入方框中输入检索词(词间可用逻辑组配)。 2.2.3 在右边字段设定方框中选定相应检索词的字段。缺省值为“Word”,左边选项方框中选择词间的关系组配符。此处缺省值“AND” 。 2.2.4在下图框中设定各检索词在文献记录中的位置关系(同一文献,同一字段或间隔单词数等)。 2.2.5用鼠标点击【Search】键,开始检索。检索完毕后,屏幕出现检索结果,显示检索到的文献题目。对检索词的输入,系统允许使用代字符“?”及通配符“*”。每一个“?”代表一个字符,如:“Base?”代表检索词可为“Bases”或“Based”等, “*”符号表示单词前方一致。另外,还可以输入“OR”组配符连接而成的简单检索式,如:Strength or toughness。 2.3 化学物质分级名称检索(Subst键) CA on CD的化学物质分级名称索引与印刷版的化学物质索引基本相同,是按化学物质的母体名称进行检索的,有各种副标题及取代基。由于印刷版CA时间跨度较长,在化合物的命名方面出现了前后不一致的情况,给检索带来一些困难。而CA on CD则克服了这个缺点,在历卷累积索引的化学物质名称保持了统一。 2.3.1在检索窗口中,用鼠标点击 按键或从“Search”命令菜单中选择“Substance Hierachy”命令,系统即进入化学物质分级名称检索窗口: 屏幕显示物质第一层次名即母体化合物名称索引正文。无下层等级名的化合物条目中直接给出CA登录号;有下层名称的物质前则出现“+”符号。 2.3.2 双击选中索引,将分级索引表一层层打开,再用鼠标双击该物质条目即可进行检索。检索完毕后,屏幕给出其相关文献检索结果。 2.4 分子式检索(Form键) 分子式索引由A-Z顺序排列,检索过程与化合物分级名称检索相似。 2.5 其它功能 书签功能,是用于把检索到认为有价值的文献做标记,以备今后需要时调用,只要单击菜单条的“bookmark”,再单击“ADD…”,即可把感兴趣的文献用这一文献标题作为项目名储存起来。今后如果要看以前已经检索到的特别有意义的文献,就可以通过“bookmark”直接调用,而不必进行重复的检索过程 3.检索结果显示 3.1 可对感兴趣的文献用【Mark】键进行标注,或用【Unmark】键取消标注。 3.2 单击【SaveMk】键存储所标注的检索结果,单击【Save】键存储当前屏幕显示内容。 3.3 单击【PrintMk】可选打印格式来输出检索结果,单击【Print】键打印当前屏幕显示内容。 3.4 双击选中的文献题目,可得到全记录内容。 当检索出文献的全记录时,一些小图标被激活,它们的作用如下所述: Goto 当光标在某CAS号处单击“Goto”可以看这一CAS号的相关化合物的物质信息。 NextLink 在检出的文献中快速定位到CAS号处。 SrchSel 把检索结果中选择的Word项(标题、文摘、关键词)的某词作进一步连接检索。 DDS 把这一记录做成CASDDS格式,以索取原始文献。 这些被激活的图标中,最有意义的是【SrchSel】,它是“Search Selection”的缩写。如果从这一结果中看到某一词有扩检意义,把光标定在这一词的前面,拖动鼠标把这一词加强,再单击【SrchSel】,即可把所有包含有这一词的文献直接检出。 4. CA on CD 检索实例 前面我们已经大致介绍了CA on CD产品的界面和操作方法,以下就几个具体实例来进一步介绍CA on CD的使用技巧。使用过印刷本的CA读者都知道,对于印刷本的查询,检索方法主要依靠CA提供的索引,根据不同的情况可选择适当的索引进行检索。而检索的途径主要分为以下几种: a) 主题索引:主题索引是检索印刷本CA的最重要、最常用的索引,包括关键词索引、化学物质索引、普通主题索引三种,通过查询得到所需资料的文摘号即可直接查阅文摘。 b) 作者及序号索引:包括作者索引、专利索引、登记号索引,这几种索引编排较简单,检索也比用主题索引方便,但必须了解作者姓名、专利号或者CA登记号,因此该种途径就有其局限性。 c) 分子式及环系索引:在已知分子式的情况下,可利用分子式索引或环系索引查出该化学物质的名称,再转查化学物质索引,该法在检索具有复杂结构化合物的时候较为适用。 作为CA on CD,它秉承了印刷版CA的索引体系,并在原有的体系基础上增添了其他一些索引特征如:“journal”、“language”以及“Doc type”等等,使整个索引体系更加完善,检索文献更加精确。同时CA on CD也兼备了电脑联机检索的优点,并采用WINDOWS环境下的菜单式界面,操作非常方便。因此无论是对于熟悉印刷版CA的化学化工研究人员还是初学者或是其他行业人员均能轻易上手,其检索的高效性、易操作性以及资料的全面性和精确性确实是显而易见的。 为了让读者能深入体会CA on CD的使用技巧,以下的实例均采用了印刷版CA和CA on CD两种检索工具,通过彼此之间的对比,使读者能够轻松上手。 实例一:天花粉蛋白用于治疗艾滋病的最早专利文献 a)印刷版CA的查询方法:天花粉蛋白,英文名Trichosanthin。由于蛋白质属于大分子,只能通过普通主题索引检索,而在印刷版中直接以该物质的名称作为主题词检索是无法检测到文献的,因为在印刷版中,所有的蛋白质均在普通主题索引中的“Proteins”下检索。可是这一主题下网罗了大量的文献,在第11次累积索引中“Proteins”下没有限定词,需要逐条查询,经查找未发现符合条件的记录。到第12次累积索引时,由于蛋白质品种太多,新增了“specific and class”的限定词,从“Index Guide”得知,天花粉蛋白的检索线索为: Protein, specific and class Trichosanthin 然后在第12次累积索引的普通主题索引中找到Trichosanthin,其中关于治疗艾滋病的文献可逐条寻找,获得文献3篇: human immunodeficiency virus infection treatment with, 111: P209144e human immunodeficiency virus inhibition treatment by, 111: 230s injection cong., for AIDS and cancer and hepatitis, 113: P120815b 据此分析,第一篇申请的专利应该是111: P209144e,文献的题目是: Methods of selectively inhibiting human immunodeficiency virus with ribosome-inactivating protein 由加州大学Berkeley分校的Lifen,Jeffrey与香港的Yeung教授一起申请的专利,专利号为PCT Int. Appl. WO 88/09,123。若想得知其专利保护和等同专利情况,则可根据此专利号查阅同一期的专利索引。 b)CA on CD的查询方法:采用CA on CD查询则不需要上述如此繁琐费时。我们只需要在“Search”方式下将已知的天花粉蛋白的名称Trichosanthin和AIDS两个关键词采用布尔逻辑AND关系的检索途径即可(见下图)。 在第11次累积索引的光盘数据库中没有找到合适的记录,切换至第12次累积索引数据库后依然采用相同的检索条件,顺利检索出三篇符合条件的文献(见下图)。 逐篇阅读发现文摘号为111:209144的专利文摘正是所需要寻找的文献,这与印刷版CA检索出的结果一致(见下图)。 若想得知其专利保护和等同专利情况,则可在“Search”或“Browse”方式下将所检索到的专利号采用专利号项目(patent)检索,就可获得同一期间该专利的专利保护和等同专利情况(见下图)。 本题目也可以采用普通主题项目(Gen. Subj.)检索,但通过从“Index Guide”得知的线索检索较为麻烦,无法准确而迅速地获得检索结果。在检索此类具有明显主题词的文献时,尽量采用单元词项目(word)的布尔逻辑检索,但同时应当注意单词的缩写,如在检索化学药物的药理学文献时,“pharmacology”和其缩写“pharmacol.”均应当以布尔逻辑或(or)运算的形式出现在“Search”方式的检索项目栏内。 实例二:催化氢化制备医药中间体间三氟甲基苯胺的工艺方法 a)印刷版CA的查询方法:本例子涉及到查询具体化合物的有关文献,由于本题目化合物命名采用的是俗名,在不知道间三氟甲基苯胺在CA中的命名的情况下,只得从分子式索引着手。其分子式为C7H6F3N,查得结果如下: Benzenamine, ar-(trifluoromethyl)- …… —, 3-(trifluoromethyl)- [98-16-8] See Chemical Substance Index 以Benzenamine为母体,查第11次累积索引的化学物质索引,在Benzenamine栏下找到以—,3-(trifluoromethyl)- [98-16-8]为副标题的文摘主题,然后寻找到prepn.条目下的记录: prepn. of by flourination and redn. of nitrobenzotrichloride, 105: P226004c by hydrogenation of nitro compd., catalysts for, 102: 166379e 经分析比较,发现文摘号为102: 166379e符合课题要求。 b)CA on CD的查询方法:进入第11卷累积索引的光盘数据库,在“Form”的方式下,将分子式C7H6F3N输入检索栏,得到以四个化合物作为母体的检索结果(见下图), 选择Benzenamine为母体,在Benzenamine(SUBSTITUTED)目录下找到—,3-(trifluoromethyl)- [98-16-8],从而获得目标化合物的命名信息及CA登记号(见下图)。 而此时若按下【Document】键则将会显示出所有该期索引中所有与该化合物有关的文摘,这个例子中我们检索到与间三氟甲基苯胺有关的文摘有161篇。若逐篇查看显然没有必要,此时只需在“Search”的方式下,将所获得化合物的CA登录号[98-16-8]和hydrogenation(氢化)以及preparation(prepn.)进行布尔逻辑检索,得到9篇命中记录(见下图): 分析后得到文摘号为102: 166379文献符合条件,这是由前苏联的Savchenko, V. I.和Dorokhov, V. G.两人所发表的工作,文章题目经翻译如下: Catalysts and new technology for production of aromatic amines by hydrogenation of nitro compounds under normal hydrogen pressure. 本题目也可采用“Sudst”的方式检索,但前提是必须正确分析化合物的母体,从而获得该化合物具体的检索信息,再同以上操作,在“Search”方式下获得所需的文摘记录。 实例三:Merck公司在法莫替丁药物研究方面的文献 a)印刷版CA的查询方法:对于这方面课题的查询,印刷版CA提供的检索方法就有些困难。从课题的要求看,此课题可通过两种方法来获得有关资料,第一种从公司着手查作者索引,第二种方法从物质名着手查化学物质索引。Merck公司的名称为Merck and Co., Inc.,物质名为Famotidine。如果采用第一种方法查作者索引,发现在13次累积索引中查Merck and Co., Inc.,结果发现有上千条记录。因为Merck公司是一个跨国大公司,每年都有很多研究成果发表,如果逐条寻找所花的精力和时间均较多,不合适使用。只有采用化学物质索引查询了,经过结构的分析获得分子式为C8H15N7O2S3,通过分子式索引知道其化学名称为Propanimidamide,3-[[[2-[(aminoiminomethyl)amino]-4-thiazolyl]methyl]thio]-N-(ami-osulfonyl)- [76824-35-6],然后查化学物质索引,找到有关法莫替丁的文摘,可是由于对该药物的研究成果较多,而且在化学物质索引中的记录不包含作者信息,这就给查询带来了困难,只能逐篇查找分析,也需要花掉大量时间和精力。 b)CA on CD的查询方法:采用光盘数据库就简单多了,只需在“Search”的方式下,选择浏览项目为“Organization”,检索字段为Merck and Co., Inc.,与单元词Famotidine进行布尔逻辑检索,即可得到检索结果(见下图)。 图3-8 实例四: 某人专门从事有关心率不齐(cardiac arrest)的药物治疗研究,他已经查阅了CA2000年9月以前的文章,现在2000年全部CA已经收到,要求补查10-12月中有关这一主题的文献。 a)印刷版CA的查询方法:采用印刷版CA时,由于时间的关系,有的时候卷索引尚未收到,只得使用10-12月期间每一期的CA,用cardiac作为关键词逐本检索。如果有卷索引的话,就可以通过普通主题索引去查找。而在普通主题索引中,用cardiac arrest是查不到所需文献的,应该利用Index Guide的附录I解决问题,经查找比较,将Heart作为检索入口,disease and disorder作为限定词最为合适。如此还需逐条查找,分析所找到的记录是否是在10-12月期间所新报道的。 b)CA on CD的查询方法:遇到这种情况,CA on CD就十分容易,利用检索项目中的“Update”功能即可轻松实现课题的要求。采用“Search”方式,用项目“Update”对2000-10、2000-11、2000-12进行提问,与单元词cardiac arrest进行布尔逻辑检索就能得到所要的结果(见下图)。 但同时必须注意,由于CA on CD不同于STN,不支持用括号的提问式,所以检索项的次序安排非常重要。一般来说,总是把“逻辑或”先做,再做“逻辑与”。而用cardiac arrest提问,意味着检索出的文献中这两个词必须相邻,并且cardiac在arrest的前面。单击【Search】之后,显示获得27篇文献。 从以上四个不同的例子可以看出,CA on CD产品利用了计算机信息技术,使以往的印刷版CA的查询方式出现了革命性的变化,检索方式的多样性、查询文献的高效性以及界面的易操作性使CA on CD必将代替印刷版CA成为新世纪美国化学文摘的主要检索工具。 |
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