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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 在服务器控制台archive，手动存档后，输出文件是存在哪里的啊
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量化新手

新虫 (正式写手)

[求助] 在服务器控制台archive，手动存档后，输出文件是存在哪里的啊

rt，求高手大侠帮忙啊，还有我要在一台服务器上使用多个cpu/核，在win界面选择并行的时候提交到服务器无法计算，不选择的时候可以计算，但默认只有一个核。在win上计算的时候可以选择多个，请问是需要在哪里设置吗？我搞了好久天都搞不出来啊，求帮助
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新手上路，请多关照
1楼 2011-11-17 17:43:43
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xw2008

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-11-18 12:05:53
量化新手(金币+1): 2011-11-23 10:44:42
你在设置的时候，有个job control /选中Run in parallal on  你自己设定几个核。
试一下吧
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2楼2011-11-17 20:53:00
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xw2008 at 2011-11-17 20:53:00:
你在设置的时候，有个job control /选中Run in parallal on  你自己设定几个核。
试一下吧

试过了，我会做那一步，但是选择多个核并行计算的时候，如图所示， parallal那里打上勾交到服务器上无法计算，点击计算的时候弹出对话框，说计算失败，不打勾的时候就可以计算，但是只默认一个核在计算。不交到服务器，而在自己电脑上选择打勾多核计算是可以的，请问各位大侠是怎么回事啊，我应该在服务器上怎么设置啊
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新手上路，请多关照
3楼2011-11-18 09:46:25
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theallz

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-11-21 19:22:37
量化新手(金币+2): 2011-11-23 10:44:53
引用回帖:
3楼: Originally posted by 量化新手 at 2011-11-18 09:46:25:
试过了，我会做那一步，但是选择多个核并行计算的时候，如图所示， parallal那里打上勾交到服务器上无法计算，点击计算的时候弹出对话框，说计算失败，不打勾的时候就可以计算，但是只默认一个核在计算。不交到服 ...

查看你的服务器端hpmpi的安装情况。

配置好ssh，nfs，正确修改machine.linux文件。
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4楼2011-11-21 17:08:34
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by theallz at 2011-11-21 17:08:34:
查看你的服务器端hpmpi的安装情况。

配置好ssh，nfs，正确修改machine.linux文件。

我昨天将hpmpi已经安装好了，在重装软件的时候检测到hpmpi已经安装上，然后就提示我在machine.linux文件修改一个节点一个节点的cpu设置，但是我是在一台服务器上使用并行啊，也需要修改machine.linux文件吗？
在后面的安装中有提示mpi配置ssh，我选择的yes
nfs共享好像有的说不要共享呢，由于我还不知道怎么共享，所以还没弄这一步啊
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新手上路，请多关照
5楼2011-11-22 09:46:43
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by theallz at 2011-11-21 17:08:34:
查看你的服务器端hpmpi的安装情况。

配置好ssh，nfs，正确修改machine.linux文件。

按照我目前的安装状态，提交一个作业上去一会就跳出来了，看Project Log
最后警告说的是，discover已完成：Discover has finished with no outputfile

这样还是因为并行没有安装上的原因吗？我感觉好像是其他原因呢，高手能帮我分析分析吗
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6楼2011-11-22 09:57:15
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theallz

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
贺仪(金币+1): 多谢指教！ 2011-11-23 08:55:06
引用回帖:
5楼: Originally posted by 量化新手 at 2011-11-22 09:46:43:
我昨天将hpmpi已经安装好了，在重装软件的时候检测到hpmpi已经安装上，然后就提示我在machine.linux文件修改一个节点一个节点的cpu设置，但是我是在一台服务器上使用并行啊，也需要修改machine.linux文件吗？
在 ...

如果仅使用单机的话，就不需要配置machine.linux和配置NFS了。
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7楼2011-11-23 08:43:27
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theallz

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
贺仪(金币+2): 多谢你的热心帮助 2011-11-23 08:55:17
引用回帖:
7楼: Originally posted by theallz at 2011-11-23 08:43:27:
如果仅使用单机的话，就不需要配置machine.linux和配置NFS了。

1. 并行问题，关闭gateway（在linux下面使用~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/gwstop）后，尝试在你的Gateway配置里面修改：

~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/root_default/dsd/conf/gw-info.sbd
~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/root_default/dsd/conf/gwparams.cfg

将其中的

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh -prot -f APPFILE

修改为

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE

之后重新启动gateway（~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/gwstart）查看是否正常。

2. 在手动将计算作业archive之后，如果操作正常，作业会保存到/home/theall/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/root_default/dsd/jobs-archived目录下面。

3. 对于并行的配置也可以在gateway网页中进行，同样对gateway data中mpicommand进行修改即可。
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8楼2011-11-23 08:51:29
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theallz

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
贺仪(金币+1): 多谢建议 2011-11-23 08:55:32
量化新手(金币+2): 2011-11-23 10:45:07
引用回帖:
8楼: Originally posted by theallz at 2011-11-23 08:51:29:
1. 并行问题，关闭gateway（在linux下面使用~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/gwstop）后，尝试在你的Gateway配置里面修改：

~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/Gateway/root_default/dsd/conf/gw-i ...

Correlation：
因为对论坛功能使用不熟悉，上贴中内容：

修改为

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE

应该为：

修改为

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh -TCP -prot -f APPFILE
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9楼2011-11-23 08:53:22
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by theallz at 2011-11-23 08:53:22:
Correlation：
因为对论坛功能使用不熟悉，上贴中内容：

修改为

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE

应该为：

修改为

mpicommand= ...

谢谢谢谢，真的太感谢了，我再弄一弄
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10楼2011-11-23 09:12:47
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