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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by theallz at 2011-11-23 08:53:22:
Correlation：
因为对论坛功能使用不熟悉，上贴中内容：

修改为

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE

应该为：

修改为

mpicommand= ...

呵呵，真的好感谢你啊，这个问题已经纠结我一周多了，今天按照你得方式进行修改命令终于可以了，那么我再有一个问题，在服务器控制台上stop job掉得工作，能不能再接着提交上去进行计算啊，如果可以操作方式是什么啊？
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11楼2011-11-23 09:48:40
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by theallz at 2011-11-23 08:53:22:
Correlation：
因为对论坛功能使用不熟悉，上贴中内容：

修改为

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE

应该为：

修改为

mpicommand= ...

我的并行是应该可以了，但是总的CPU使用率很低啊，显示为0.0%,只有并行那几个显示100%，我的服务器是一个cpu，cpu是4个核，详细见一下：

-bash-3.2$ cat /proc/cpuinfo
processor       : 0
vendor_id       : GenuineIntel
cpu family      : 6
model           : 23
model name      : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU    Q9550  @ 2.83GHz
stepping        : 10
cpu MHz         : 2833.018
cache size      : 6144 KB
physical id     : 0
siblings        : 4
core id         : 0
cpu cores       : 4
fpu             : yes
fpu_exception   : yes
cpuid level     : 13
wp              : yes
flags           : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips        : 5669.61
clflush size    : 64
cache_alignment : 64
address sizes   : 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:

processor       : 1
vendor_id       : GenuineIntel
cpu family      : 6
model           : 23
model name      : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU    Q9550  @ 2.83GHz
stepping        : 10
cpu MHz         : 2833.018
cache size      : 6144 KB
physical id     : 0
siblings        : 4
core id         : 1
cpu cores       : 4
fpu             : yes
fpu_exception   : yes
cpuid level     : 13
wp              : yes
flags           : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips        : 5666.01
clflush size    : 64
cache_alignment : 64
address sizes   : 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:

processor       : 2
vendor_id       : GenuineIntel
cpu family      : 6
model           : 23
model name      : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU    Q9550  @ 2.83GHz
stepping        : 10
cpu MHz         : 2833.018
cache size      : 6144 KB
physical id     : 0
siblings        : 4
core id         : 2
cpu cores       : 4
fpu             : yes
fpu_exception   : yes
cpuid level     : 13
wp              : yes
flags           : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips        : 5665.97
clflush size    : 64
cache_alignment : 64
address sizes   : 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:

processor       : 3
vendor_id       : GenuineIntel
cpu family      : 6
model           : 23
model name      : Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU    Q9550  @ 2.83GHz
stepping        : 10
cpu MHz         : 2833.018
cache size      : 6144 KB
physical id     : 0
siblings        : 4
core id         : 3
cpu cores       : 4
fpu             : yes
fpu_exception   : yes
cpuid level     : 13
wp              : yes
flags           : fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm syscall nx lm constant_tsc pni monitor ds_cpl vmx smx est tm2 cx16 xtpr lahf_lm
bogomips        : 5666.05
clflush size    : 64
cache_alignment : 64
address sizes   : 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:


计算的时候top后这样显示：
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12楼2011-11-23 10:41:27
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theallz

金虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 量化新手 at 2011-11-23 10:41:27:
我的并行是应该可以了，但是总的CPU使用率很低啊，显示为0.0%,只有并行那几个显示100%，我的服务器是一个cpu，cpu是4个核，详细见一下：

-bash-3.2$ cat /proc/cpuinfo
processor       : 0
vendor_id      ...

现在是非常正常的CPU使用情况啊。

top命令查看的CPU使用，nice有100%。
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13楼2011-11-25 14:47:27
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theallz

金虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 量化新手 at 2011-11-23 10:41:27:
我的并行是应该可以了，但是总的CPU使用率很低啊，显示为0.0%,只有并行那几个显示100%，我的服务器是一个cpu，cpu是4个核，详细见一下：

-bash-3.2$ cat /proc/cpuinfo
processor       : 0
vendor_id      ...

关于top的使用，请参考：

http://www.hudong.com/wiki/linux+top
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14楼2011-11-25 14:48:36
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by theallz at 2011-11-25 14:47:27:
现在是非常正常的CPU使用情况啊。

top命令查看的CPU使用，nice有100%。

真的呀，谢谢谢谢啊，哈哈哈，那照这个进度，我的东西要算很久很久咯？
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15楼2011-11-25 16:20:02
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by theallz at 2011-11-25 14:48:36:
关于top的使用，请参考：

http://www.hudong.com/wiki/linux+top

灰常感谢
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16楼2011-11-25 16:24:09
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量化新手

新虫 (正式写手)
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14楼: Originally posted by theallz at 2011-11-25 14:48:36:
关于top的使用，请参考：

http://www.hudong.com/wiki/linux+top

你好，方便把你得qq号留给我吗？谢谢
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17楼2011-11-25 16:50:51
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量化新手

新虫 (正式写手)
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9楼: Originally posted by theallz at 2011-11-23 08:53:22:
Correlation：
因为对论坛功能使用不熟悉，上贴中内容：

修改为

mpicommand=/apps/mpi/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh Sample Text -prot -f APPFILE

应该为：

修改为

mpicommand= ...

你好，我又有问题了，同样的文件在我自己win的电脑上（一个2G的cpu）计算的时候11个小时就出来了，不过选择并行的时候，也选择的4，因为有4个虚拟的核。但在服务器上并行，4个cpu，每个cpu2个G，都2天多了还没算完，是不是程序（linux下）或软件有问题哦，
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18楼2011-12-02 15:28:17
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theallz

金虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by 量化新手 at 2011-12-02 15:28:17:
你好，我又有问题了，同样的文件在我自己win的电脑上（一个2G的cpu）计算的时候11个小时就出来了，不过选择并行的时候，也选择的4，因为有4个虚拟的核。但在服务器上并行，4个cpu，每个cpu2个G，都2天多了还没算 ...

Intel的超线程技术对于计算没啥意义。建议关闭。
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19楼2011-12-02 15:55:34
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量化新手

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by theallz at 2011-12-02 15:55:34:
Intel的超线程技术对于计算没啥意义。建议关闭。

但是不关的话会影响计算速度吗？
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20楼2011-12-02 16:31:36
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