24小时热门版块排行榜    

查看: 1825  |  回复: 2

dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)

[交流] ms 中轨迹文件分析问题 已有1人参与

ms 中轨迹文件分析问题,后缀his或xtd的轨迹文件,是否可以转换成其他格式,用其他软件打开。同时如何看到里面每个原子在每个构象的坐标(我知道一个一个轨迹可以保存为pdb,或cif格式进行看,但是是否有类似xyz文件一样的可以看到每个step的坐标。)
另外,每个step的温度压力,等是否看到
我看到有的人用ms模拟后进行焓和熵,吉布斯自由能的计算,如何实现呢?
希望高人指导
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

自古明王圣帝,犹须勤学,况凡庶乎!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sanyecao1984

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-16 16:56:15
试试看在分析结果图中直接拷贝,然后黏贴到excel中,这样会有每个原子对应每个构象的变化,至少我以前在分析能量波动和内聚能的时候是这样做的。
2楼2011-11-16 13:16:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)

这个是分析以后进行的,这个我知道,使用txt,打开也可以看到这些结果。我的问题是直接把轨迹文件转换,
自古明王圣帝,犹须勤学,况凡庶乎!
3楼2011-11-16 13:21:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dreamfly_ykf 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见