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sai00fuji

金虫 (正式写手)

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[交流] 关于ORF的选择，以及启动子的疑问

1、不同物种的同一个蛋白的mRNA，他们的-35,-10SD区域有保守性吗？我找了几个cDNA比对，没发现什么保守性啊
2、应该怎样解释，5‘-UTR中有N个ATG，但只选择其中的一个作为起始密码子呢？生物体到底是怎样的识别机制啊，真核蛋白放到大肠杆菌中表达，会有影响吗
3、启动能力强弱之分怎么判断呢，会影响表达速率否

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1楼 2011-11-14 17:18:23

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啊Q精神

木虫 (小有名气)

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
amisking(金币+4): 鼓励积极应助！ 2011-11-14 19:29:00
sai00fuji(金币+2): 就是说同一个蛋白的启动子区域在不同物种中没有保守性吗？我觉得自己的疑问主要还是在于如何识别起始密码子、。。。 2011-11-14 19:29:33

1.根据物种的进化历程，亲缘越近，保守性越高，反之亦然。不同物种的cDNA保守性很难说吧，看亲缘关系了。
2.选择启动子后第一个ATG作为起始密码子，核糖体识别mRNA后沿启动子向下移动遇到第一个ATG起始转录；真核蛋白在大肠杆菌中表达有无影响的问题，多少会有。因真核蛋白翻译后有一系列糖基化，氨基化等加工修饰过程，而大肠杆菌不具备这些功能。
3.通过起始转录的能力或者表达同一蛋白的水平高低进行区分。会影响表达速率的，起码相同时间段表达量差很多。说白了，有时是1g/l
和1mg/l的区别

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