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月下冰魂

木虫 (正式写手)

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[求助] abinit软件安装（加50金币）

最近在paper上看到用软甲模拟硅/SiO2图形片界面硅的外延生长，模拟开始2-4层原子的沉积。感觉很有用，很想试一试。下来几个版本的abinit，就是安装不上，主要是对linux系统不熟悉，哪位能不能提供abinit软件，然后详细说明在linux上的详细安装步骤。主要是安装步骤哦。我的linux是小红帽3。
然后给出安装后的模拟的基本操作更好哦。要是安装上的，再加50金币哦。
各位大神，前来帮忙哦。

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奋斗。。。

1楼2011-11-10 13:36:21

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

heechao

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖交流！ 2012-04-05 10:26:15
月下冰魂: 金币+15, ★有帮助 2012-04-09 08:24:50

1，如果使用gcc-4.1编译的openmpi, 后面abinit在make时会出现编译问题:
error: bad value (native) for -mtune= switch
所以重新安装gcc-4.5.0.

2 安装gcc-4.5.0之前要安装三个程序包，分别为：gmp-4.3.2，mpfr-2.4.2，mpc-0.8.1。按顺序安装到自己目录中，
$ ../configure --prefix="/home/zjma/program/gmp-4.3.2"
$../configure --prefix="/home/zjma/program/mpfr-2.4.2" --with-gmp="/home/zjma/program/gmp-4.3.2/"
$../configure --prefix="/home/zjma/program/mpc-0.8.1" --with-gmp="/home/zjma/program/gmp-4.3.2/" --with-mpfr="/home/zjma/program/mpfr-2.4.2/"

3 安装gcc-4.5.0
$ ../configure --prefix="/home/zjma/program/gcc-4.5.0" --with-gmp="/home/zjma/program/gmp-4.3.2/" --with-mpfr="/home/zjma/program/mpfr-2.4.2/" --with-mpc="/home/zjma/program/mpc-0.8.1/"
$ make
$ make install

4 使用gcc-4.5.0重新编译openmpi-1.4
$ ../configure FC="/home/zjma/program/gcc-4.5.0/bin/gfortran" CC="/home/zjma/program/gcc-4.5.0/bin/gcc" CXX="/home/zjma/program/gcc-4.5.0/bin/g++" F77="/home/zjma/program/gcc-4.5.0/bin/gfortran" --prefix="/home/zjma/program/openmpi-1.4.2"
$ make
$ make install

5 下载abinit6.6.1的所有插件到~/.abinit/tarballs/下
地址：http://www.abinit.org/downloads/plug-in-sources

6 使用新编译的openmpi安装并行版abinit6.6.1
$ ../configure --prefix="/home/zjma/abinit-6.6.1" --with-mpi-prefix="/home/zjma/program/openmpi-1.4.2/" --enable-mpi="yes" | tee 1
$ make
$ make install