ms中吸附能的计算 - 第一性原理 - MS - 第2页小木虫论坛-学术科研互动平台

Believeinyourself,impossibleisnothing.

11楼2011-12-06 16:30:07

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acridine

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贺仪(金币+1): 多谢指教！ 2011-12-07 10:22:55

内存不足吧，比如
not enough memory for: 513  total with workspace arrays: 2048.2 MB
not enough memory for: 197  total with workspace arrays: 1533.5 MB
还有
insufficient memory for this job
increase Max_memory if possible to    1168.7 MB
这些提示

12楼2011-12-06 17:07:36

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flymice

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12楼: Originally posted by acridine at 2011-12-06 17:07:36:
内存不足吧，比如
not enough memory for: 513 total with workspace arrays: 2048.2 MB
not enough memory for: 197 total with workspace arrays: 1533.5 MB
还有
insufficient memory for th ...

我设置的时候给的最大memory是8000M，应当不存在这个问题，所以我对于这个错误提示很是无语。

Believeinyourself,impossibleisnothing.

13楼2011-12-06 18:24:21

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acridine

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贺仪(金币+2): 多谢指教！ 2011-12-07 10:23:03

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13楼: Originally posted by flymice at 2011-12-06 18:24:21:
我设置的时候给的最大memory是8000M，应当不存在这个问题，所以我对于这个错误提示很是无语。

但目前看就是由于内存不足而跳出。
因为都没有开始计算，所以不像是参数设置或结构上的错误。（不过参数或结构上的设置倒是有可能导致消耗的内存量过大）
看上去你似乎在用本机计算，不知道你的机器有没有成功计算过类似的耗内存的计算。
或者你可以测试一下：比如针对纳米管，不断增加管长计算，直到出现内存不足的提示，看一下实际能计算的体系究竟有多大。

14楼2011-12-06 19:13:25

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flymice

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14楼: Originally posted by acridine at 2011-12-06 19:13:25:
但目前看就是由于内存不足而跳出。
因为都没有开始计算，所以不像是参数设置或结构上的错误。（不过参数或结构上的设置倒是有可能导致消耗的内存量过大）
看上去你似乎在用本机计算，不知道你的机器有没有成功 ...

我是用本机来算的。我看了我电脑的内存，好像是3.80G可用，所以这个应该是内存的原因了。但是我一般电脑内存4G已经是很好的了，莫非连这个小任务都要用服务器算？还是换成unix版的要好些？

Believeinyourself,impossibleisnothing.

15楼2011-12-07 13:50:25

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acridine

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15楼: Originally posted by flymice at 2011-12-07 13:50:25:
我是用本机来算的。我看了我电脑的内存，好像是3.80G可用，所以这个应该是内存的原因了。但是我一般电脑内存4G已经是很好的了，莫非连这个小任务都要用服务器算？还是换成unix版的要好些？

这个...其实200多原子怎么说也不算小任务了。
如果你的硬件内存很大，但win系统无法完全识别，那么改成linux可能会有所帮助，否则可能还是无法突破内存的限制。
可以考虑简化下参数或结构，比如你的cell水平方向取了50埃，不妨考虑减小一些，不过我不确定在dmol中这个设置对使用的内存有没有影响。

16楼2011-12-07 17:14:26

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flymice

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16楼: Originally posted by acridine at 2011-12-07 17:14:26:
这个...其实200多原子怎么说也不算小任务了。
如果你的硬件内存很大，但win系统无法完全识别，那么改成linux可能会有所帮助，否则可能还是无法突破内存的限制。
可以考虑简化下参数或结构，比如你的cell水平方 ...

恩，谢谢，我试试看吧。应该是可以更小些的。

Believeinyourself,impossibleisnothing.

17楼2011-12-07 18:19:34

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clapham

18楼2011-12-28 21:49:55

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hanpeng972

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liliangfang(金币+1): 多谢交流 2012-01-03 12:59:09

不知道MS计算参数过程和你的结构大小选取有关，也就是可能你的体系过大，这个模块计算不了。这个你也需要考量一下，还有你的服务器性能。

青春无悔

19楼2012-01-03 09:30:04

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flymice

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19楼: Originally posted by hanpeng972 at 2012-01-03 09:30:04:
不知道MS计算参数过程和你的结构大小选取有关，也就是可能你的体系过大，这个模块计算不了。这个你也需要考量一下，还有你的服务器性能。

谢谢，我计算了比较小的体系，已经能够运算了。