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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 优化配合物出错
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luyating2005

金虫 (小有名气)

[求助] 优化配合物出错

优化四配位的金属配合物，结果配位键在gaussview中总是显示断键，有师兄说是因为键长太长，gaussview自动显示为不相连的键，这样理解对吗？但是以后每一步都用到这个构型，调结构的时候不好调啊？还是我把它连一块再调？还是一开始我优化的结构就有问题啊？望各位大侠指点，偶确实是困扰好多天了。。。先在此谢过了
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1楼 2011-11-07 08:35:53
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-11-07 10:16:13
luyating2005(金币+2): 这样啊，谢谢，那以后每一步再算，优化完之后还是断开的，找过渡态的时候也没影响吗？那我如果写文章， 2011-11-07 10:27:31
不用MM的话，断键无所谓~~
调结构时候连起来调就是
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惺惺相惜情不自禁
2楼2011-11-07 09:59:08
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luyating2005

金虫 (小有名气)
不好意思，刚刚没写完整，那我以后写文章的时候，文章上的结构也是直接把算好的结构直接连上吗？不是把断开的那种图放上边吧？
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3楼2011-11-07 10:30:59
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小红豆(金币+3): 应助奖励 2011-11-07 13:52:00
luyating2005(金币+3): 我下一步让它成六配位的，是在这个优化好的结构上再加配体，加配体的时候不还的调结构吗，是猜的下一步的构型 2011-11-07 15:02:42
文章中连不连完全看你需要~一般默认gaussian输出的结果
另外我不知道你为什么要以一个猜测结构作为你后面的参考，而不用优化好的结构。
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惺惺相惜情不自禁
4楼2011-11-07 10:40:57
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woxiangfei

木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
小红豆(金币+2): 应助奖励 2011-11-07 13:52:16
最好把键调短点，连上，在优化，我这几天也是，老是连不上，后来调短了，连上后从新算，后来出现的结果总能量比没连上的要低，是更稳定的结构。
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5楼2011-11-07 13:27:16
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xiao@chen

木虫 (著名写手)

坛主

【答案】应助回帖

我师兄也跟我说过这个问题，他每年说这个没有关系的，这个连不连上是软件默认的显示问题，不连上并不就是说明他们之间没有相互作用，只是比较弱，小于软件显示的范围而已，所以没有关系的。我师兄写文章的时候都是根据需要看是否需要把它连接上，然后再在chem3d里面连上就是。
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已在不知不觉中没落，要在先知先觉中崛起
6楼2011-11-07 14:35:17
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
愿你能得到个好的结果，小心优化
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惺惺相惜情不自禁
7楼2011-11-07 15:16:01
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luyating2005

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by manson1998 at 2011-11-07 10:40:57:
文章中连不连完全看你需要~一般默认gaussian输出的结果
另外我不知道你为什么要以一个猜测结构作为你后面的参考，而不用优化好的结构。

我后面还要再把它变成六配位的，需要在这个结构上再加俩配体，是在优化出来的结构上再加上的,这是第一步，看着配位键断了就一直在找问题。。。
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8楼2011-11-07 15:19:04
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luyating2005

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by woxiangfei at 2011-11-07 13:27:16:
最好把键调短点，连上，在优化，我这几天也是，老是连不上，后来调短了，连上后从新算，后来出现的结果总能量比没连上的要低，是更稳定的结构。

好的，谢谢，我再试试，以前只关注从gaussview看的结果，没太注意能量，那连上后再优化是不还是断开，但能量降低了？
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9楼2011-11-07 15:21:28
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luyating2005

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by manson1998 at 2011-11-07 15:16:01:
愿你能得到个好的结果，小心优化

谢谢啊，愿大家一切如愿
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10楼2011-11-07 15:22:49
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