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优化配合物出错
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luyating2005
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优化配合物出错
优化四配位的金属配合物,结果配位键在gaussview中总是显示断键,有师兄说是因为键长太长,gaussview自动显示为不相连的键,这样理解对吗?但是以后每一步都用到这个构型,调结构的时候不好调啊?还是我把它连一块再调?还是一开始我优化的结构就有问题啊?望各位大侠指点,偶确实是困扰好多天了。。。先在此谢过了
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1楼
2011-11-07 08:35:53
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【答案】应助回帖
我师兄也跟我说过这个问题,他每年说这个没有关系的,这个连不连上是软件默认的显示问题,不连上并不就是说明他们之间没有相互作用,只是比较弱,小于软件显示的范围而已,所以没有关系的。我师兄写文章的时候都是根据需要看是否需要把它连接上,然后再在chem3d里面连上就是。
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已在不知不觉中没落,要在先知先觉中崛起
6楼
2011-11-07 14:35:17
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【答案】应助回帖
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gmy1990(金币+2): 2011-11-07 10:16:13
luyating2005(金币+2): 这样啊,谢谢,那以后每一步再算,优化完之后还是断开的,找过渡态的时候也没影响吗?那我如果写文章, 2011-11-07 10:27:31
不用MM的话,断键无所谓~~
调结构时候连起来调就是
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2楼
2011-11-07 09:59:08
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luyating2005
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不好意思,刚刚没写完整,那我以后写文章的时候,文章上的结构也是直接把算好的结构直接连上吗?不是把断开的那种图放上边吧?
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3楼
2011-11-07 10:30:59
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manson1998
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小红豆(金币+3): 应助奖励 2011-11-07 13:52:00
luyating2005(金币+3): 我下一步让它成六配位的,是在这个优化好的结构上再加配体,加配体的时候不还的调结构吗,是猜的下一步的构型 2011-11-07 15:02:42
文章中连不连完全看你需要~一般默认gaussian输出的结果
另外我不知道你为什么要以一个猜测结构作为你后面的参考,而不用优化好的结构。
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4楼
2011-11-07 10:40:57
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