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kelvinpolyu

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请问96G的内存, 12核, 2.66GHz 的电脑配置, CASTEP能计算最多的原子数 ？

请问96G的内存, 12核, 2.66GHz 的电脑配置, CASTEP 能计算最多的原子数 ？计算时间? 谢谢
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1楼 2011-11-03 02:52:18
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sunboyccc

铁杆木虫 (正式写手)
★
uuv2010(金币+1): 欢迎参加讨论 2011-12-15 13:14:42
引用回帖:
8楼: Originally posted by lbambool at 2011-11-03 14:27:52:
能算多少原子主要由内存大小决定，算多久主要由CPU数量和主频决定，同时两方面又都和体系的电子复杂程度和计算精度有关，一般来说，96G内存castep可以算600-800个原子吧，简单的一点的估计可以算到1000个，不过12 ...

有些误人，呵呵，之前测试显示，两颗Xeon5650 2.66G，12核，耗费内存能力比两颗四核心的E5620大很多，内存也不是按比例分配的，据测试结果分析，有磁性原子掺杂的情况下，能算144个原子就不错了，精度高一点的话加U就困难了，算光学性质也费劲，给一个参考，48原子磁性掺杂高精度计算10天正常！
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12楼2011-12-14 19:56:15
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sunboyccc

铁杆木虫 (正式写手)
★
uuv2010(金币+1): 欢迎参加讨论 2011-12-15 13:13:16
引用回帖:
13楼: Originally posted by souledge at 2011-12-14 20:10:57:
具体的内存分配方式可以看CASTEP的输出文件，里面有提到总共多少个node参与计算，这些node又被分为多少个group，而每个node的平均使用内存为多少。
如果用过PWscf的话，应该能体会到，这个差别是在于pool的个数 ...

呵呵，我只是就“单机计算”说一说，并且不同的软件（或相同软件不同版本）或不同系统情况又不同啦，没有涉及小型机多节点计算。
我的感觉：单机、windows系统的情况下，同样是四核或六核CPU，主频越高、性能越好的CPU，需内存越多，对6核2.66GCPU来说，可能对每个核配置8G内存就够，但对六核3.33GCPU来说，每个核需配置16G内存，这就像大师傅需要大的操作空间一个道理。
此外，计算效率方面，众所周知Linux强于Windows，所需内存又不一样，所以配置计算用单机要综合考虑，希望以上对一些虫友能有帮助。
关于Castep输出文件中可以看到内存使用情况应该是在配完机器后，在使用Castep计算后的结果里面出现，那是后话啦。越说越多。。。不好意思
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14楼2011-12-14 22:05:44
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sunboyccc

铁杆木虫 (正式写手)
★
uuv2010(金币+1): 欢迎参加讨论 2011-12-15 13:14:10
引用回帖:
15楼: Originally posted by souledge at 2011-12-15 01:23:11:
这就是说得单机计算啊……只不过在CASTEP和VASP中都是使用node来表示一个并行进程，而在PWscf、Abinit中则是使用Processor来表示的而已~
尽管软件之间的设计各有不同，但是总的来说对内存的使用规则是一定的，那 ...

呵呵，非常感谢你的指教。
CASTEP输出文件会给出一些提示，但经验告诉我，它并不准，就以计算时间为例，CASTEP最终结果会给出一个任务计算时间，我计算几百个任务后得出的结论是，机器给出的时间与时钟得出的并不一致，差很多。至于内存的使用量的问题，我也是根据实际使用情况得出的结论，而不是软件的输出结果。我用两颗Xeon5650与两颗Xeon5620分别用24G与48G内存测试了许多任务后，根据内存的实际使用情况得出的结论，当然不一定是真理。
其实“内存决定能不能算，Cpu决定任务计算快慢”是对的，我只是说能算600-1000原子有点误人，因为我实际使用这种配置的机器根本算不了那么多，当然不同计算方法也许能够实现。
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17楼2011-12-15 12:45:36
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sunboyccc

铁杆木虫 (正式写手)
★
uuv2010(金币+1): 欢迎参加讨论 2011-12-15 13:14:17
此外，我觉得内存使用不仅与K点和E-Cut有关，比如在算电荷密度时，提高精度即scaling-factor的设置，对内存量使用影响巨大，只用单CPU6核计算四个原子可以耗费30G内存。
如果我的话引起误会还请原谅，只是根据一点实际的使用经验，并不一定科学，请多指教！
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18楼2011-12-15 13:01:45
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sunboyccc

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
19楼: Originally posted by lbambool at 2011-12-15 16:23:03:
我前面也说了能算多少原子和各项设置精度、电子复杂程度、算法等都有关系，电子结构越复杂，设置精度越高，内存开销越大，这是正常的，所以能算多少个原子没有一个确定的值。所以说单核８G对某些体系只能计算１４ ...

您好！其实您说的关于内存的分配没错，我只是觉得根据我算的情况达不到600-1000原子而已，我觉得对于新手配置个机器不容易，怕误导他们，复杂的情况他们并一定了解，有什么说的不对的地方还请海涵！也请今后多多指教！
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20楼2011-12-15 17:02:41
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