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pengzhang1

银虫 (小有名气)

[求助] 金属配合物结构问题

我想对自己合成出来的一个晶体进行结构优化,由于本人不是做计算的,想请教各位大侠。gaussionview里画的结构可以是我解单晶解出来的结构吧?还是查阅文献找出对应过渡金属的配位模式再自己预测一个新的配位结构?对于晶体聚合物,应该算的是二聚体吧,还是金属配位模式就可以了?
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雨晨田木

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
pengzhang1(金币+8): 2011-11-04 10:13:12
小红豆(金币+3): 应助奖励 2011-11-07 13:55:58
就像我前面说的聚合物最多算到六聚体,如果算不出来的话,就算到五聚体或四聚体,总之能算几个算几个。至于具体计算方法,可以先用半经验方法AM1优化,然后用DFT方法,非金属原子用3-21g(d),金属原子用ECP赝势基组,赝势基组可以选SDD或Lanl2DZ,如果是稀土的话,就只能用SDD。最后用之前的优化结构,仍用DFT方法,把基组加大到6-31g(d)(非金属原子)再优化一次。最后如果计算机允许的话,可以用更高的三收缩基基组来做单点能计算,不过这一步对不是专门做计算的文章来说,不是必需的。
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=雨晨田木&say=不要太辛苦哦。[/img][/url]
8楼2011-11-04 10:08:54
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查看全部 15 个回答

雨晨田木

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-11-02 10:10:56
pengzhang1(金币+5): 2011-11-02 19:55:42
可以根据单晶结构来画初始结构。聚合物的结构,一般用六聚体的的结构代替。其如果想模拟聚合物的性质,可以计算单体到六聚体的性质,然后进行拟合就行了(比如说HOMO,LUMO)。如果单体分子实在太多,计算量太大,只算到四聚体或五聚体。
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2楼2011-11-02 10:02:52
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雨晨田木

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小红豆(金币+2): 应助奖励 2011-11-07 13:55:35
我问个问题,聚合物怎么会有晶体呢,是不是寡聚物啊?如果是寡聚物,那么就直接当成单分子来算就行了。
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3楼2011-11-02 10:13:52
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pengzhang1

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 雨晨田木 at 2011-11-02 10:13:52:
我问个问题,聚合物怎么会有晶体呢,是不是寡聚物啊?如果是寡聚物,那么就直接当成单分子来算就行了。

金属有机配合物里面我们都说是金属有机聚合物,具有重复单元,该领域好像没听过寡聚物啊?如果算五六聚体的话得有56百个原子,得算到什么时候啊?什么叫“直接当成单分子”?请赐教
4楼2011-11-02 20:04:16
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