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pengzhang1银虫 (小有名气)
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金属配合物结构问题
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| 我想对自己合成出来的一个晶体进行结构优化，由于本人不是做计算的，想请教各位大侠。gaussionview里画的结构可以是我解单晶解出来的结构吧？还是查阅文献找出对应过渡金属的配位模式再自己预测一个新的配位结构？对于晶体聚合物，应该算的是二聚体吧，还是金属配位模式就可以了？ |
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2楼2011-11-02 10:02:52
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5楼2011-11-03 10:09:19
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6楼2011-11-03 10:54:02
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【答案】应助回帖
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pengzhang1(金币+8): 2011-11-04 10:13:12
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| 就像我前面说的聚合物最多算到六聚体，如果算不出来的话，就算到五聚体或四聚体，总之能算几个算几个。至于具体计算方法，可以先用半经验方法AM1优化，然后用DFT方法，非金属原子用3-21g（d），金属原子用ECP赝势基组，赝势基组可以选SDD或Lanl2DZ，如果是稀土的话，就只能用SDD。最后用之前的优化结构，仍用DFT方法，把基组加大到6-31g（d）（非金属原子）再优化一次。最后如果计算机允许的话，可以用更高的三收缩基基组来做单点能计算，不过这一步对不是专门做计算的文章来说，不是必需的。 |
8楼2011-11-04 10:08:54
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9楼2011-11-04 10:17:55
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| 是的，可以算一下不同多重度时的总能量，取能量最低的那一种多重度，最好再算一下6，5，6。Co Ni Cu 都是过渡金属第一行的元素，其实是可以不用赝势基组的，只要对所有原子都用6-311g（d，p）基组就行了。具体你可以看一下这篇文献：DFT-B3LYP, NPA-, and QTAIM-Based Study of the Physical Properties of [M(II)(H2O)2(15-crown-5)] (M = Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn) Complexes （dx.doi.org/10.1021/jp2001157）。还要注意一个BSSE的问题，不然审稿人可能会提意见，也可以参考那篇文献。 |
10楼2011-11-07 10:42:55
