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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 建模中加H的问题
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zhxy06

金虫 (初入文坛)

[求助] 建模中加H的问题

Ms建模时，用H钝化直接用adjust hydrogen，有些原子加不上H，不知道怎么回事，如果手动，怎么加 ？望高手解答，谢谢
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1楼 2011-10-30 16:07:12
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by zhxy06 at 2011-11-15 10:56:47:
你好，我换了和原胞一样的K点路径计算，还是没有解决这个问题，请帮帮忙

‘我换了和原胞一样的K点路径计算“
这是怎么可能？最多你能包含原胞的k点，虽然你的kpoints文件一样，但是k点是根据你的poscar理的晶胞变化的。你想要解决问题的话吧你的 原包和超胞，以及你的原包的k点画出来吧，我帮你找k点
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
13楼2011-11-15 11:01:46
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
★
uuv2010(金币+1): 多谢分享 2011-10-30 18:31:18
自己解决了，view-explorers-properties explorers，找到原子的坐标，
计算出要添加的原子坐标，add atom，option中改成carstesin，ok啦
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2楼2011-10-30 17:03:35
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
★ ★
franch(金币+2): 鼓励交流，，把出错信息贴出来 2011-10-31 13:15:42
有人看到不，模型与文献一致了，但现在出现的问题是计算总是出错。是计算机的内存不够？
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3楼2011-10-31 11:54:13
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杨寻

铁杆木虫 (著名写手)
加氢键的时候老是提示 超出了坐标值 你晓不晓得怎么回事？ 谢谢
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4楼2011-11-01 19:46:01
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