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win雨

银虫 (小有名气)

[求助] DS虚拟筛选

最近用DS建了个药效团,准备用它做个虚拟筛选。可是搞不清DS中
ligand profilter,ligand pharmacophore mapping,search 3D database, screen Library之间的区别,他们都可以用来做虚拟筛选吗?有什么区别呢?
希望师兄师姐们指点一下,谢谢啦。
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win雨

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by blue_cat at 2011-10-30 16:02:29:
ligand profilter:是如果你又一个化合物,不知道它的靶点,可以用这个来找一下,前提是你有license;
ligand pharmacophore mapping:我用这个看几个化合物和要小团匹配的情况;
search 3D database:一般用来进 ...

那ligand pharmacophore mapping 也应该可以用来做筛选吧?我还想问一下,build 3D database 中,我明明让它产生构象了,可发现化合物的数量并没有增加是问什么啊?谢谢啦。。。。
3楼2011-10-31 14:50:46
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查看全部 3 个回答

blue_cat

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-30 16:23:21
win雨(金币+5): 谢谢 2011-10-31 20:14:47
ligand profilter:是如果你又一个化合物,不知道它的靶点,可以用这个来找一下,前提是你有license;
ligand pharmacophore mapping:我用这个看几个化合物和要小团匹配的情况;
search 3D database:一般用来进行药效团虚拟筛选,前提是你已经用build 3d database建立了数据库;
screen Library:用的很少,具体用途你可以查看帮助文档。
DS
2楼2011-10-30 16:02:29
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