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yzmaize

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于偏分离

最近小弟在搞那个偏分离，这个要做卡方测验的时候要统计每个marker的分子型分布，这个要怎么个统计法，就是说要知道一个marker中亲本1、亲本2的基因型各是多少，求助，有哪些方法
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1楼 2011-10-27 19:48:39
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★
缺友情(金币+2, 农林EPI+1): 优秀应助，授予EPI，欢迎常来农林版！ 2011-11-02 20:42:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by yzmaize at 2011-10-29 12:40:20:
我要知道的是统计每个标记的分子基因型，比如说a有多少个，b有多少个，因为有100多个marker，群体也蛮大，手动搜索什么的比较麻烦，想问问有没有一次把全部都统计好的方法

你要统计a有多少，b有多少，用Excel中countif条件统计 countif（range，a）就能统计出a有多少个，b有多少个。
每个单株的任一标记的基因型必须要自己跑胶自己亲自读的，我们以前做的是136个RIL，800个SSR加EST标记！
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真相是最大的奢侈品
6楼2011-10-29 14:10:27
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yzmaize

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
1楼: Originally posted by yzmaize at 2011-10-27 19:48:39:
最近小弟在搞那个偏分离，这个要做卡方测验的时候要统计每个marker的分子型分布，这个要怎么个统计法，就是说要知道一个marker中亲本1、亲本2的基因型各是多少，求助，有哪些方法

来个高手指点下啊~~~~
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2楼2011-10-28 21:52:14
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
木虫/panda(金币+6): 辛苦专家~ 2011-10-29 14:23:18
看你是什么群体
RIL 每个标记的理论分离比为1:1, 做卡方检验,可得到每个标记是否符合1:1的分离比
F2 理论比为1:2:1,也可以做卡方检验
用SPSS的非参数检验可一次算出所有的Marker
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真相是最大的奢侈品
3楼2011-10-28 23:35:31
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yzmaize

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-28 23:35:31:
看你是什么群体
RIL 每个标记的理论分离比为1:1, 做卡方检验,可得到每个标记是否符合1:1的分离比
F2 理论比为1:2:1,也可以做卡方检验
用SPSS的非参数检验可一次算出所有的Marker

你好，我做的是RIL，这个要做卡方测验的时候是不是要先把每个标记的a，b统计出来
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4楼2011-10-29 12:38:15
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