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yzmaize

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于偏分离

最近小弟在搞那个偏分离,这个要做卡方测验的时候要统计每个marker的分子型分布,这个要怎么个统计法,就是说要知道一个marker中亲本1、亲本2的基因型各是多少,求助,有哪些方法
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yzmaize

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by yzmaize at 2011-10-27 19:48:39:
最近小弟在搞那个偏分离,这个要做卡方测验的时候要统计每个marker的分子型分布,这个要怎么个统计法,就是说要知道一个marker中亲本1、亲本2的基因型各是多少,求助,有哪些方法

来个高手指点下啊~~~~
2楼2011-10-28 21:52:14
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
木虫/panda(金币+6): 辛苦专家~ 2011-10-29 14:23:18
看你是什么群体
RIL 每个标记的理论分离比为1:1, 做卡方检验,可得到每个标记是否符合1:1的分离比
F2 理论比为1:2:1,也可以做卡方检验
用SPSS的非参数检验可一次算出所有的Marker
真相是最大的奢侈品
3楼2011-10-28 23:35:31
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yzmaize

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-28 23:35:31:
看你是什么群体
RIL 每个标记的理论分离比为1:1, 做卡方检验,可得到每个标记是否符合1:1的分离比
F2 理论比为1:2:1,也可以做卡方检验
用SPSS的非参数检验可一次算出所有的Marker

你好,我做的是RIL,这个要做卡方测验的时候是不是要先把每个标记的a,b统计出来
4楼2011-10-29 12:38:15
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yzmaize

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-28 23:35:31:
看你是什么群体
RIL 每个标记的理论分离比为1:1, 做卡方检验,可得到每个标记是否符合1:1的分离比
F2 理论比为1:2:1,也可以做卡方检验
用SPSS的非参数检验可一次算出所有的Marker

我要知道的是统计每个标记的分子基因型,比如说a有多少个,b有多少个,因为有100多个marker,群体也蛮大,手动搜索什么的比较麻烦,想问问有没有一次把全部都统计好的方法
5楼2011-10-29 12:40:20
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★
缺友情(金币+2, 农林EPI+1): 优秀应助,授予EPI,欢迎常来农林版! 2011-11-02 20:42:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by yzmaize at 2011-10-29 12:40:20:
我要知道的是统计每个标记的分子基因型,比如说a有多少个,b有多少个,因为有100多个marker,群体也蛮大,手动搜索什么的比较麻烦,想问问有没有一次把全部都统计好的方法

你要统计a有多少,b有多少,用Excel中countif条件统计 countif(range,a)就能统计出a有多少个,b有多少个。
每个单株的任一标记的基因型必须要自己跑胶自己亲自读的,我们以前做的是136个RIL,800个SSR加EST标记!
真相是最大的奢侈品
6楼2011-10-29 14:10:27
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yzmaize

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-29 14:10:27:
你要统计a有多少,b有多少,用Excel中countif条件统计 countif(range,a)就能统计出a有多少个,b有多少个。
每个单株的任一标记的基因型必须要自己跑胶自己亲自读的,我们以前做的是136个RIL,800个SSR加EST标 ...

了解,你说的这个excel函数是要一个个marker的统计么
7楼2011-10-29 16:25:20
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

yzmaize(金币+1): 2011-11-02 20:25:08
先统计第一个marker,然后往后一拉,带格式的复制,不就OK了!
真相是最大的奢侈品
8楼2011-10-29 16:36:26
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根


木虫/panda(金币+1): 辛苦了,代楼主给你一个,呵呵 2011-11-01 23:10:03
1个金币你也不给我?呵呵!
真相是最大的奢侈品
9楼2011-11-01 20:24:48
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yzmaize

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wanhscn at 2011-11-01 20:24:48:
1个金币你也不给我?呵呵!

已经给了,呵呵,不好意思,我也不是太注意这个,感谢您多次的帮助,受益匪浅!
10楼2011-11-02 20:25:55
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