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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 组装分子库
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家强

木虫 (著名写手)

[求助] 组装分子库

我现在已经下载下来了linux版的小分子库了，也全部解压了，本来做虚拟筛选一个部分一个部分筛就可以，但是老板让我把这几部分组装起来一起筛，现在不知道怎么组装，想求助大家，谢谢。

[ Last edited by 家强 on 2011-10-26 at 16:28 ]
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1楼 2011-10-26 15:08:07
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
家强(金币+2): 2011-10-27 15:02:41
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-10-27 17:13:13
用Linux的cat命令，就可以合并一起。
赞一下(2人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
2楼2011-10-27 07:00:47
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-31 18:49:08
家强(金币+8): 3 2011-10-31 22:55:49
cat aronis_p1.0，aronis_p0.1，aronis_p0.0 >; aronis_p_total
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
6楼2011-10-31 14:35:14
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家强

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ts2009 at 2011-10-31 14:35:14:
cat aronis_p1.0，aronis_p0.1，aronis_p0.0 >; aronis_p_total

弱弱的问一下我现在已经弄成了windows版的小分子了，在sybyl和ds中能组装在一起，要怎么做呢？
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7楼2011-10-31 22:58:02
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民
★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-11-01 16:40:08
引用回帖:
7楼: Originally posted by 家强 at 2011-10-31 22:58:02:
弱弱的问一下我现在已经弄成了windows版的小分子了，在sybyl和ds中能组装在一起，要怎么做呢？

分子没有什么win版或什么其他版的。只是在WIN下或是LINUX下有不同的分子格式表示方法。你现在应该是得到了小分子的SDF格式的文件，这两种文件，sybyl或是DS都是直接可以导入的。如果是又很多碎片文件需要整合成一个文件的话，就要自己编一个小脚本或是借助与一些软件来实现。祝好运。
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
8楼2011-10-31 23:05:02
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民
其实我还是不是很明白，你做虚拟筛选的话，完全可以一个一个碎片文件地筛。大概也许是你们老板让你多学学LINUX的吧。呵呵
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
9楼2011-10-31 23:06:51
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民
引用回帖:
10楼: Originally posted by 家强 at 2011-11-02 15:17:42:
是的，我的主意是一个一个碎片分子集合筛库，但是老板这次要自己动手做，又闲一个一个碎片分子集合筛库麻烦，所以想整合到一起去，那能帮我编个脚本文件么，谢谢。

具体来说你有多少个碎片分子文件？过段时间也许可以帮你看看
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
11楼2011-11-02 15:48:59
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普通回帖

家强

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tjegg at 2011-10-27 07:00:47:
用Linux的cat命令，就可以合并一起。

能再具体点么，能否举个例子。我在zinc下下载了aronis下的分子，解压之后出来三个aronis_p1.0，aronis_p0.1，aronis_p0.0三个片段小分子库，现在就是想把这三个片段组装成一个大的。请赐教。
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3楼2011-10-27 15:07:01
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家强

木虫 (著名写手)
大家帮帮忙啊，不希望再次被老板批了。
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4楼2011-10-28 09:21:38
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家强

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tjegg at 2011-10-27 07:00:47:
用Linux的cat命令，就可以合并一起。

能否帮忙一下，我实在没办法了
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5楼2011-10-30 10:29:54
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家强

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by ts2009 at 2011-10-31 23:06:51:
其实我还是不是很明白，你做虚拟筛选的话，完全可以一个一个碎片文件地筛。大概也许是你们老板让你多学学LINUX的吧。呵呵

是的，我的主意是一个一个碎片分子集合筛库，但是老板这次要自己动手做，又闲一个一个碎片分子集合筛库麻烦，所以想整合到一起去，那能帮我编个脚本文件么，谢谢。
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10楼2011-11-02 15:17:42
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