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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[交流] 再往前,走向哪里? 已有9人参与

计算模拟版改版之后,我就向区内若干虫友约稿了。收到我约稿通知的虫子可注意了,不经过一两年,我是不会放弃的。还是乖乖发帖投稿吧,期待看到你们码出来的文字!从我自己开始吧,希望是个好的开始。

我觉得,改版后的计算模拟版最大的亮点,就是【寂寞随想】栏目。想想看,成天对着满屏黑白字段还能想得天花乱坠的虫子,真的就是木头吗?他们的脑瓜里,到底存在什么样的世界呢?

学计算的虫子,一路走来,大多都有许多“凄惨”的故事。每天提交任务,调整参数,分析结果,似乎是没完没了的循环。满怀欣喜的投入计算模拟的世界,希望从此步入胜景,踏入通向真理的光辉大道。

菜鸟到入门的阶段总是烦恼伴着兴奋,每天都会有些收获。这些里程碑你跨过了几个?MS终于在linux系统上装上了;VASP编译终于成功了;参照文献的计算结果终于跟文献相符了;结构优化,总能计算,态密度计算,NEB计算,CNEB计算,dimer计算,频率计算,bader,xcrysden,ELF, PARCHG,vesta,  putty, lev00……一路走过来,好像也不没有那么困难。

那么,接着怎么办?换不同的体系重复这些计算过程和分析手段?软件学会了,参数弄清楚了,那什么才是科研呢?猜测一些事情,然后做出模型来,用不同的软件算些稀奇古怪的性质。我们似乎又陷入了平凡乏味的生活,一切好像都不那么吸引人,结果似乎都可以预见。我算不出来的,实验也不见得揭示的清楚。我算得出来的,似乎也不需要太关心。

什么是科研?做计算模拟的虫子,当你玩转程序了,也看清楚了别人的源代码了,你的人生还有什么意义呢?还需要做什么?再开发一次别人写过的程序,或者用自己的程序实现别人实现过的功能,或者自己修修补补,提高一下计算速度或者精度?你的,让你自己激动不已的,可以让自己安心的贡献在哪里?

计算模拟的虫子,下一站,走向哪里?

[ Last edited by cenwanglai on 2011-10-26 at 00:41 ]
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jq120

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
cenwanglai(金币+2): 谢谢回复! 2011-10-26 00:46:16
楼上,我觉得这就是一工具。
STM的结果你信吗?为什么?
X射线的结果你信吗?为什么?
……
我会相信这些东西,因为他们有那么多的理论依据,有那么多的旁证。
同样,我也相信计算的结果。因为他们也有那么多的理论依据和佐证。
我不觉得做计算的主要工作就是调整参数,主要工作还是模拟——不过是用计算机模拟。我也不觉得做计算的就只能使用计算机,谁规定木匠不许使瓦刀?
我觉得根本还是科研,感兴趣的话什么工具都可以用,不过计算机熟悉一下罢了。
2楼2011-10-26 00:20:56
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
2楼: Originally posted by jq120 at 2011-10-26 00:20:56:
楼上,我觉得这就是一工具。
STM的结果你信吗?为什么?
X射线的结果你信吗?为什么?
……
我会相信这些东西,因为他们有那么多的理论依据,有那么多的旁证。
同样,我也相信计算的结果。因为他们也有那么多 ...

学习到了一个阶段,需要回过头来再看看,想想。

谢谢你的回复!期待你的分享.
3楼2011-10-26 00:45:53
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臭水沟

荣誉版主 (知名作家)

化工小生

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
cenwanglai(金币+2): 长篇大论的灌水,就来这里吧! 2011-10-26 09:50:24
区长同志,把我们版也搞个寂寞区,我们版寂寞的同志太多太多了~~

要不然一会就有同志到专业贴灌水,想灌水又要被罚款。。。

唉。。。
好好生活,勤奋科研!个人博客:http://blog.sina.com.cn/seais1314
4楼2011-10-26 09:22:13
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GLPengXMC

银虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-10-25 23:08:05:
计算模拟版改版之后,我就向区内若干虫友约稿了。收到我约稿通知的虫子可注意了,不经过一两年,我是不会放弃的。还是乖乖发帖投稿吧,期待看到你们码出来的文字!从我自己开始吧,希望是个好的开始。

我觉得, ...

楼主已经达到了很高的境界,令人羡慕!
我是新手,刚学vasp、MS,还是菜鸟级的水平,以后请您多指点呀,也让我快点地进步。
另外,您在帖子中提到:
bader,xcrysden,ELF, PARCHG,vesta,  putty, lev00……
这些都是一些软件,对吗?
其中,一些我已经下到了(例如,最新的 VESTA 3.0.1正式版全系列;xcrysden)。
其它的:
bader, ELF, PARCHG,  putty, lev00……
哪里可以下呀?
您能把网址告诉我吗?
或者,麻烦您把它们,Windows版或者Linux版,发到我的邮箱:zzjjyy1@sohu.com,我的这个邮箱容量很大,可以接收很大的附件。
我先谢谢您啦!

[ Last edited by GLPengXMC on 2011-10-28 at 15:29 ]
5楼2011-10-28 15:03:29
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gingko8293

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
cenwanglai(金币+2): 你是说:作出想要的科研来? 2011-10-28 17:07:59
其实像你们这种做模拟的,再做点试验的话,相结合说不定可以做出自己想要的软件来。
6楼2011-10-28 16:38:44
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by GLPengXMC at 2011-10-28 15:03:29:
楼主已经达到了很高的境界,令人羡慕!
我是新手,刚学vasp、MS,还是菜鸟级的水平,以后请您多指点呀,也让我快点地进步。
另外,您在帖子中提到:
bader,xcrysden,ELF, PARCHG,vesta,  putty, lev00… ...

百度一下或者google一下就知道了。

bader, parchg,ELF是vasp带的性质计算功能,在INCAR里面设置一下就好了。

lev00是跟vesta一样的免费vasp电荷密度相关文件的处理程序,linux下运行。

bader计算需要去http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/下载代码,按照网页上的说明重新编译vasp就可以了。
7楼2011-10-28 17:07:22
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tuhaidan

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-10-28 17:07:22:
百度一下或者google一下就知道了。

bader, parchg,ELF是vasp带的性质计算功能,在INCAR里面设置一下就好了。

lev00是跟vesta一样的免费vasp电荷密度相关文件的处理程序,linux下运行。

bader计算需要去 ...

你好,我的vasp  安装遇见问题了,有点小崩溃,可以帮帮我吗?
vasp5.2   串行   
CPU: intel P4 2-core

thd@ubuntu:~/installed/vasp.5.2$ which icc
/opt/intel/composerxe-2011.4.191/bin/ia32/icc
thd@ubuntu:~/installed/vasp.5.2$ which ifort
/opt/intel/Compiler/11.1/075/bin/ia32/ifort
thd@ubuntu:~/installed/vasp.5.2$

thd@ubuntu:~/installed/vasp.5.2$ icc -v
Version 12.0.4
thd@ubuntu:~/installed/vasp.5.2$ ifort -v
Version 11.1
thd@ubuntu:~/installed/vasp.5.2$
  
vasp5.2makfile:
FC=ifort
BLAS=-L/opt/intel/Compiler/11.1/075/mkl/lib/32  -lmkl_intel -lmkl_sequential -lmkl_core  -lguide -lpthread
LAPACK= ../vasp.5.lib/lapack_double.o
其他的没有改动
  make:
。。。。。
chi.o: In function `xi_mp_set_gw_from_algo_.':
chi.f90.text+0x13539): undefined reference to `strip_'
chi.f90.text+0x13540): undefined reference to `lower_'
chi.f90.text+0x13547): undefined reference to `length_'
make: *** [vasp] Error 1
  
请问这是什么原因啊?   真的很需要帮助!!谢谢你了
8楼2011-11-03 18:45:16
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
8楼: Originally posted by tuhaidan at 2011-11-03 18:45:16:
你好,我的vasp  安装遇见问题了,有点小崩溃,可以帮帮我吗?
vasp5.2   串行   
CPU: intel P4 2-core

thd@ubuntu:~/installed/vasp.5.2$ which icc
/opt/intel/composerxe-2011.4.191/bin/ia32/icc
t ...

请到第一性原理求助。那边有更多人讨论这个。
9楼2011-11-03 19:33:42
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PSA

专家顾问 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
cenwanglai: 欢迎来这里分享~ 2011-11-09 14:35:29
引用回帖:
2楼: Originally posted by jq120 at 2011-10-26 00:20:56:
楼上,我觉得这就是一工具。
STM的结果你信吗?为什么?
X射线的结果你信吗?为什么?
……
我会相信这些东西,因为他们有那么多的理论依据,有那么多的旁证。
同样,我也相信计算的结果。因为他们也有那么多 ...

说的真好,赞一个
10楼2011-11-09 13:13:43
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