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请教各位高手一个关于酶的问题！
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各位高手： 我初做实验，遇到一个棘手又困惑的问题。 我想研究胶原酶 Collagenase 的活性，需要寻找能够被Collagenase切断的肽底物。看过文献后发现同是Collagenase的底物，氨基酸的序列却大相径庭，例如 RGDC-------- J. AM. CHEM. SOC. 2006, 128, 10378-10379 GGLGPAGGCG------Biochemical and Biophysical Research Communications 334 (2005) 1317–1321 Dnp-Pro-Cha-Gly-Cys(Me)-His-Ala-Lys(NMa)-NH2------Peptides International's Catalog ------之上均是可以被Collagenase切断的肽底物 我真是困惑了。 Collagenase 的切断位点到底是什么？是不是有一个底物设计的原则可以遵循呢？ 谢谢你们的帮助！ |
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2楼2006-12-15 18:12:11
3楼2006-12-15 21:52:37
4楼2006-12-15 22:05:45
继续
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The collagenases mainly cleave interstitial collagens (type I, II and III), unlike other MMPs, their substrate specificity is well defined. Collagenase action on the α2-macroglobulin results in the cleavage of Gly-Leu Peptide bond[5]．They cleave the Gly-Ile peptide bond of α1(I) chain of collagen and Gly-Leu peptide bond of α2(I) chain of collagen[5]. The substrate cleavage pattern for collagenases is that P1 residue is invariably hydrophobic (Leu, Ile, Val) and that P1 is usually Gly or a hydrophobic residue[5,16]. ------------这是我查到的一段关于之上问题的知识，我的理解是：只要设计含有Gly-Leu 的氨基酸序列这段序列就会被胶原酶切断，例如 GGLC，AGLC-------- 不知我的理解对吗，谢谢你的进一步回复！ |
5楼2006-12-17 15:30:11