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voleyes

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[求助] 什么软件能模拟给定PH值的酸碱环境下的MD？

如果给定一个PH值的溶液，怎么来模拟？
比如 HCl 溶液，直接向体系中加离子就行吗

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1楼 2011-10-17 03:02:16

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voleyes

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引用回帖:

4楼: Originally posted by jawang at 2011-10-18 18:19:28:
如果是模拟蛋白质体系，让蛋白在某一个PH值下进行MD模拟的话，amber和charmm是可以做的。
如果不是蛋白质的体系的话，就不清楚了

谢谢，不是蛋白质体系

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5楼2011-10-18 22:06:34

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vallen

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-10-18 09:38:01
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-10-18 20:16:28
voleyes(金币+5): 2011-10-25 23:48:57

在MD模拟里没有办法指定PH值吧

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2楼2011-10-17 15:47:57

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voleyes

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是吗？没有办法模拟吗？

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3楼2011-10-17 22:17:37

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jawang

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-18 20:16:16

如果是模拟蛋白质体系，让蛋白在某一个PH值下进行MD模拟的话，amber和charmm是可以做的。
如果不是蛋白质的体系的话，就不清楚了

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4楼2011-10-18 18:19:28

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