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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 什么软件能模拟给定PH值的酸碱环境下的MD？
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voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 什么软件能模拟给定PH值的酸碱环境下的MD？

如果给定一个PH值的溶液，怎么来模拟？
比如 HCl 溶液， 直接向体系中加离子就行吗
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1楼 2011-10-17 03:02:16
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jawang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-18 20:16:16
如果是模拟蛋白质体系，让蛋白在某一个PH值下进行MD模拟的话，amber和charmm是可以做的。
如果不是蛋白质的体系的话，就不清楚了
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4楼2011-10-18 18:19:28
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vallen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-10-18 09:38:01
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-10-18 20:16:28
voleyes(金币+5): 2011-10-25 23:48:57
在MD模拟里没有办法指定PH值吧
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2楼2011-10-17 15:47:57
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voleyes

银虫 (正式写手)
是吗？没有办法模拟吗？
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3楼2011-10-17 22:17:37
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voleyes

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jawang at 2011-10-18 18:19:28:
如果是模拟蛋白质体系，让蛋白在某一个PH值下进行MD模拟的话，amber和charmm是可以做的。
如果不是蛋白质的体系的话，就不清楚了

谢谢，不是蛋白质体系
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5楼2011-10-18 22:06:34
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