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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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gloryping

铁杆木虫 (小有名气)


[交流] PCR引物

大家帮忙看看我的PCR引物如何:
forward:5’-3’:AAA ACA GAA GGC CAA GAG CA
reverse:5’-3’:CAC CAG GCA GAG ACT TCA CA
请大家帮我分析下这对引物是否容易形成二级结构等问题,O(∩_∩)O非常感谢
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hyk_diana

银虫 (小有名气)


请问什么样的引物结构会容易形成二聚体呢?
8楼2011-10-11 15:26:09
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gloryping

铁杆木虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by arniekyo at 2011-10-10 15:24:09:
没有影响

老板说这是从文献中找到的引物(我没看到这篇文献)。现在用它来做PCR,扩出来了目的基因条带,但是存在很多非特异条带,会影响后面的定量PCR。我是引物设计方面的新手,所以来请教下大家这引物是不是不合适,谢谢!
3楼2011-10-10 15:30:51
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love_st

金虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
gloryping(金币+1): 2011-10-10 17:46:40
引用回帖:
3楼: Originally posted by gloryping at 2011-10-10 15:30:51:
老板说这是从文献中找到的引物(我没看到这篇文献)。现在用它来做PCR,扩出来了目的基因条带,但是存在很多非特异条带,会影响后面的定量PCR。我是引物设计方面的新手,所以来请教下大家这引物是不是不合适,谢 ...

上游引物自身二聚体比较严重,上下游之间也还能接受,但是3‘末端的为什么搞个A干脆不要掉得了,而且5’端的搞5个A干吗
4楼2011-10-10 16:58:09
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wqj1988926

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
gloryping(金币+1): 2011-10-10 17:46:02
楼主可以试着将目的片段送去测序,根据序列重新设计引物,保证特异性扩增
5楼2011-10-10 17:03:10
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