24小时热门版块排行榜    

查看: 328  |  回复: 1

jackyma

新虫 (小有名气)

[求助] 关于自动job投入的script的问题

参考教程http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial3/section4.htm上的脚本按照自己的系统(LSF)写了以下脚本,但是job不能进行。
使用bsub -n 8 ./heatrun.sh 投入。

请高手指教!

#heatrun.sh
#!/bin/sh

#bsub -n 8\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.001 -o heat.mdout.001 -c min.rst -r heat.rst.001 -x heat.mdcrd.001 -inf heat.mdinfo.001 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.002 -o heat.mdout.002 -c heat.rst.001 -r heat.rst.002 -x heat.mdcrd.002 -inf heat.mdinfo.002 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.003 -o heat.mdout.003 -c heat.rst.002 -r heat.rst.003 -x heat.mdcrd.003 -inf heat.mdinfo.003 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.004 -o heat.mdout.004 -c heat.rst.003 -r heat.rst.004 -x heat.mdcrd.004 -inf heat.mdinfo.004 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.005 -o heat.mdout.005 -c heat.rst.004 -r heat.rst.005 -x heat.mdcrd.005 -inf heat.mdinfo.005 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.006 -o heat.mdout.006 -c heat.rst.005 -r heat.rst.006 -x heat.mdcrd.006 -inf heat.mdinfo.006 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.007 -o heat.mdout.007 -c heat.rst.006 -r heat.rst.007 -x heat.mdcrd.007 -inf heat.mdinfo.007 -p ham.prmtop\
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackyma

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-08 10:56:10
问题已经解决!

原因是第二行开始行尾的 反斜杠“\ “把所有命令作为一行执行了,去掉之后就OK了。
2楼2011-10-05 14:26:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jackyma 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +3 pin8023 2026-02-28 5/250 2026-03-02 00:24 by 花YOU重开日
[考研] 材料复试调剂 +3 学材料的点 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:07 by ccp273206157
[考研] 求调剂 +5 yunziaaaaa 2026-03-01 6/300 2026-03-01 23:57 by ccp273206157
[考研] 292求调剂 +6 yhk_819 2026-02-28 6/300 2026-03-01 23:23 by 向上的胖东
[考研] 0854复试调剂 276 +3 wmm9 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:13 by 热情沙漠
[考研] 299求调剂 +3 Y墨明棋妙Y 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:01 by tangxiaotian
[考研] 306分材料调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:48 by 无际的草原
[考研] 0856化工专硕求调剂 +12 董boxing 2026-03-01 12/600 2026-03-01 19:45 by 材子momo
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考研] 295求调剂 +7 19171856320 2026-02-28 7/350 2026-03-01 18:54 by 18137688336
[考研] 0857调剂 +3 一ll半 2026-02-28 3/150 2026-03-01 18:32 by 热情沙漠
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 307求调剂 +5 wyyyqx 2026-03-01 5/250 2026-03-01 15:21 by Fff-1
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 材料284求调剂,一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
[考研] 264求调剂 +3 巴拉巴拉根556 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:31 by gaoxiaoniuma
信息提示
请填处理意见