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jackyma

新虫 (小有名气)

[求助] 关于自动job投入的script的问题

参考教程http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial3/section4.htm上的脚本按照自己的系统(LSF)写了以下脚本,但是job不能进行。
使用bsub -n 8 ./heatrun.sh 投入。

请高手指教!

#heatrun.sh
#!/bin/sh

#bsub -n 8\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.001 -o heat.mdout.001 -c min.rst -r heat.rst.001 -x heat.mdcrd.001 -inf heat.mdinfo.001 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.002 -o heat.mdout.002 -c heat.rst.001 -r heat.rst.002 -x heat.mdcrd.002 -inf heat.mdinfo.002 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.003 -o heat.mdout.003 -c heat.rst.002 -r heat.rst.003 -x heat.mdcrd.003 -inf heat.mdinfo.003 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.004 -o heat.mdout.004 -c heat.rst.003 -r heat.rst.004 -x heat.mdcrd.004 -inf heat.mdinfo.004 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.005 -o heat.mdout.005 -c heat.rst.004 -r heat.rst.005 -x heat.mdcrd.005 -inf heat.mdinfo.005 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.006 -o heat.mdout.006 -c heat.rst.005 -r heat.rst.006 -x heat.mdcrd.006 -inf heat.mdinfo.006 -p ham.prmtop\
mpijob mpirun /home/hpc/nagara-app/amber10.eth/exe/sander.MPI -O -i heat.mdin.007 -o heat.mdout.007 -c heat.rst.006 -r heat.rst.007 -x heat.mdcrd.007 -inf heat.mdinfo.007 -p ham.prmtop\
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jackyma

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-08 10:56:10
问题已经解决!

原因是第二行开始行尾的 反斜杠“\ “把所有命令作为一行执行了,去掉之后就OK了。
2楼2011-10-05 14:26:39
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