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西风的安逸

铜虫 (小有名气)

[求助] 反转录

反转录不是很容易成功么,可是为什么我最近做的反转录效果都很差呢,RNA跑的带很亮,浓度大概0.5~1ug/ul,这个浓度做反转录应该够了呀,而且RNA提完后马上就反转录了,条件是65度5分钟、42度1小时、85度5分钟,可是为什么就是没有cDNA呢,此问题急需得到解决,必当重谢!!!
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既然选择了远方就要风雨兼程
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子

【答案】应助回帖

1949stone(MolEPI+1): 鼓励 2011-10-04 14:12:55
RNA提取最后一步乙醇需要充分挥发后再加水溶解,残留的乙醇会影响反转录效率,DNase I 处理后要用酚氯仿抽提,注意是水饱和酚。另外你说的没有cDNA这个貌似用电泳的方法是不太合适的,成本不划算检测效果也不好,可以设计内参后等比稀释cDNA然后确定cDNA质量,当然前提是这样做对你是值得的,我一般扩扩基因,做做荧光定量都不检测cDNA质量的,这个做多了就好了,没有什么技术上的难度。在就是实验过程中防止RNA污染,个人的经验是操作台干净,不要开风机,使用进口耗材,冰上加样。
我一般反转录都是这样做的
RNA
oligo dT或oligo dT-接头
特异性引物(按实验需要确定是否加入)
5’接头引物(按实验需要确定是否加入)
随机小片段random 6等
dNTP
DEPC水配到10ul
65度预变性5min后冰上速冷
加入RT酶
RNase抑制剂配到20ul
42度1.5H
出来的cDNA一般都能符合要求
具体不明白的可以参照CLONTECH SMART RACE KIT 说明书上反转录方法
酶和抑制剂我用的promega MMLV和fermentas的
引物和接头都是上海生工合成的
其他东西都是从大连宝生物买的

反转录很简单的 祝你实验成功

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可以用QQ找我……
12楼2011-10-04 10:42:00
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