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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 如何处理含金属的蛋白的模拟
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zkz124535

禁虫 (正式写手)
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1楼 2011-09-22 19:19:21
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sinokang

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-18 20:22:10
楼上的正解，这里有相关离子的参数，http://www.pharmacy.manchester.ac.uk/bryce/amber#ion，自己添加，其实也有文献将离子直接替换成力场中具有的性质类似的离子
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3楼2011-10-18 11:04:10
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lsylsylsy

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-12 08:49:09
zkz124535(金币+5): 2011-11-04 09:06:00
你体系是含什麽金属离子，向MG,LI,NA等程序自己含有参数的。但过渡金属如ZN FE NI等是没有参数的，需要自己添加，这个可以从报道的文献添加
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-10-11 20:48:29
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