| 查看: 300 | 回复: 2 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
晶体中配体分子结构很不合理 已有1人参与
|
|||
|
大家好，我有一个蛋白-配体体系，这个蛋白中含有15个叶绿素分子，但是晶体中这些叶绿素分子的结构不是很合理，但是我的研究重点又不是叶绿素分子，在计算中我只想利用叶绿素分子的疏水性质，因为我猜测叶绿素分子和另一个重要的配体的疏水相互作用非常重要（对我要研究配体的激发态的能量）。 请问各位，遇到这种情况应该怎样处理才好，我曾经试着用UFF力场处理过叶绿素分子，可是最后的构型变得非常地不合理。我也试着用半经验的量子化学方法处理，比如PM3，MNDO以及AM1，结果发现PM3和mndo处理地比较准确。但是晶体复合物中有15个叶绿素分子，用半经验的量子化学方法并不能对每个叶绿素分子都有效，比如有些叶绿素分子能够很好地收敛，但是另一些分子却总是出错，另一些直接不能收敛。 请问各位，遇到这种情况应该怎么办？ 请指教，谢谢。 |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
» 猜你喜欢
细胞培养，这22个细节一定要注意！（一）
已经有0人回复
-
CSC访学博后项目获批，外方学校暂停合作该怎么办？
已经有51人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有181人回复
-
大湾区大学刘天辉课题组招收2026级博士生（与中山大学物理学院联合培养）
已经有22人回复
-
PbS量子点紫外吸收
已经有0人回复
-
比利时鲁汶大学与国家留学基金委共同资助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已经有0人回复
-
半透性容器进行高湿或者低湿研究
已经有0人回复
-
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生
已经有11人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有1人回复
-
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理（博士后）招聘启事
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
3楼2011-09-19 19:34:26
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
gmy1990(金币+2): 2011-09-19 13:33:50
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵gmy1990(金币+2): 2011-09-19 13:33:50
|
建议简化你的体系，只抓与配体直接相关的叶绿素分子，如二体叶绿素与配体。 你的问题可问虫友：zhi.guo@asu.edu 他的工作与你相类！ [ Last edited by zhou2009 on 2011-9-19 at 10:56 ] |
2楼2011-09-19 10:53:52
