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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

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专业: 理论和计算化学

[交流] CPMD跨节点测试讨论已有3人参与

由于计算体系比较大，进行了一次跨节点测试，结果如下：
_________________________________________________________________________________
Package       :CPMD-3.13.2
Atoms          :28
Steps          :100
cpu name : Intel(R) Xeon(R) CPU          E5620  @ 2.40GHz
cpu MHz : 1600.000
cache size : 12288 KB
Task          :Molecular Dynamics(By xk6891 @9.10.2011)
Processors    CPU_total Time    Elapsed_total Time    Peak Memory    CPU_step Time       CPU/Elapsed_total
(node*pro)          (s)                   (s)                   (Mb)             (s)                   (%)
1*1(1)          370.50             387.55             256.6          7.6315             95.60
1*2(2)          171.49             179.12             133.5          3.5349             95.74
1*3(3)          164.16             170.10                93.9          3.3532             96.51
1*4(4)          113.98             118.80                72.6          2.3430             95.94
1*5(5)          127.91             132.26                61.0          2.6110             96.71
1*6(6)          95.05             100.11                51.3          1.9683             94.95
1*7(7)          108.05             112.10                45.6          2.2114             96.39
1*8(8)          93.11             100.63                42.3          1.9781             92.53
3*4(12)          54.30             206.41                31.7          4.0891             26.31
2*8(16)          63.88             272.85                27.6          5.3826             23.41
3*8(24)          32.05             281.70                22.3          5.5381             11.38
_______________________________________________________________________________
这里的CPU time和Elapsed time来自每次计算后的Time中的值，应当分别代表是CPU计算时间和总的消耗时间吧。后面三个的跨节点运算效率极低，这是为什么呢？节点间的通信效率太低，还是脚本写的问题？

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