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序列比对
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知道一段基因序列，如何在ncbi上比对在什么物种上存在这段序列。我现在知道一段序列，想知道在小鼠，或兔子上是否有这段序列，想进行一下比对，各位大虾有什么方法，给我介绍一下，谢谢！ [ Last edited by 1949stone on 2011-9-9 at 13:00 ] |
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 【分子生物】EPI帖 |
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2楼2011-09-09 11:03:41
chenguestc
木虫 (职业作家)
- MolEPI: 7
- 应助: 576 (博士)
- 贵宾: 0.4
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- 专业: 作物分子育种
【答案】应助回帖
wanhscn: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&LINK_LOC=blasthome 2011-09-09 11:31:10
XI4ZHL(金币+2): 2011-09-09 12:39:33
1949stone(MolEPI+1): 够细致 2011-09-09 13:01:07
XI4ZHL(金币+2): 2011-09-09 12:39:33
1949stone(MolEPI+1): 够细致 2011-09-09 13:01:07
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/上这个网址 点网页左上角有个BLAST 网页出来后，再点nucleotide blast 网页再打开后，把你的序列拷贝到那个空白对话框里 选择下面的 Mouse genomic + transcript 点网页最左下角BLAST， 等待结果出来即可。 |
3楼2011-09-09 11:07:47
4楼2011-09-09 12:40:28
5楼2012-02-22 16:14:20
100