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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » southern杂交检测基因拷贝数的原理是什么？
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阿淼阿淼

新虫 (初入文坛)

[求助] southern杂交检测基因拷贝数的原理是什么？

在转基因植株中，southern杂交一般都是检测外源目的基因是否转入目标植物，但是有用southern杂交检测植物基因拷贝数，请问原理是什么？是根据怎样的实验结果来判定拷贝数呢？我不太明白，请求各位高手说明一下，感谢！！！
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1楼 2011-09-06 10:32:57
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
引用回帖:
10楼: Originally posted by 阿淼阿淼 at 2011-09-07 11:06:25:
谢谢！非常感谢您的耐心解答！
还有一些文献上是用单酶切，往往只出现一个条带，然后用与标准品根据灰度值来计算判定拷贝数，这样也是可以的吗？这两种方法的区别和适用对象又是什么呢？可以结合在一起吗？就是 ...

我们做的是植物细胞，所以觉得首选是看条带个数。灰度值跟你上样的量以及基因组提取好坏有关系，不太好控制，这个我不敢打包票。根据灰度还不如用实时荧光定量PCR分析拷贝数，这个毕竟还有加了个个内参。
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真相是最大的奢侈品
14楼2011-09-07 16:43:21
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

阿淼阿淼(金币+2): 谢谢您 2011-09-07 11:31:26
1 外源基因转入同一或者相近的位点概率很小。
2 基因组酶切产物的大小对于外源基因的插入位点具有不确定性。
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真相是最大的奢侈品
2楼2011-09-06 11:21:52
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lx33140

新虫 (初入文坛)
阿淼~这好深奥~不过我顶你。。 - - 猜猜我是谁。。。
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3楼2011-09-06 15:02:00
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阿淼阿淼

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-06 11:21:52:
1 外源基因转入同一或者相近的位点概率很小。
2 基因组酶切产物的大小对于外源基因的插入位点具有不确定性。

如果不是外源基因呢？检测植物本身的基因拷贝数呢？
是根据条带数还是灰度判断呢？
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4楼2011-09-07 08:14:26
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