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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » SYBYL X1.2下对接后如何观察H-bond的键长与键角？
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icedreamer

新虫 (小有名气)

[求助] SYBYL X1.2下对接后如何观察H-bond的键长与键角？

如题，小弟在做Surflex-Dock对接后，ligand与protein形成了氢键，为黄色虚线，很容易观察到~
但是如何查看所形成氢键的原子之间的距离以及键角呢？？

望有经验的大虾们出手相助啊！！！

[ 来自科研家族 药物化学家族 ]
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1楼 2011-09-05 10:08:32
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xuenihao

禁虫 (初入文坛)
★ ★
chaizhm(金币+2): 谢谢 2011-12-01 14:36:47
icedreamer(金币+4): 已测试可用，谢谢回帖~~ 2011-12-17 15:37:49
本帖内容被屏蔽
2楼2011-12-01 10:24:29
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夏天的鱼

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
chaizhm(金币+1): 谢谢 2011-12-01 17:49:55
icedreamer(金币+1): 这方法不错，谢谢回帖 2011-12-17 15:37:14
引用回帖:
1楼: Originally posted by icedreamer at 2011-09-05 10:08:32:
如题，小弟在做Surflex-Dock对接后，ligand与protein形成了氢键，为黄色虚线，很容易观察到~
但是如何查看所形成氢键的原子之间的距离以及键角呢？？

望有经验的大虾们出手相助啊！！！
[color=gree ...

另存结构，用你自己方便的软件打开可能会方便一点
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科研就是讨论出来的
3楼2011-12-01 16:51:35
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