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pull code 输出文件含义
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第一次用pull code 模块，输出的pullx.xvg里面的东西不是很清楚，望解答。 想算一下离子移动过程的PMF pullx.xvg一部分如下 299.9000 4.96089 2.42961 299.9200 4.96114 2.44277 299.9400 4.9615 2.45399 299.9600 4.9618 2.45783 299.9800 4.96204 2.4546 300.0000 4.96218 2.44828 第一列时间，第二列似乎是参考组的Z坐标，第三列就不知道是什么了 mdp中的pull代码如下： pull = umbrella pull_geometry = position pull_dim = N N Y pull_ngroups = 1 pull_group0 = NA2 pull_group1 = CL pull_k1 = 100 pull_vec1 = 0 0 1 pullrate1 = 0 0 0.2 pull_init1 = 0 0 6 pull_start = no 我这样写有什么问题吗？ |
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