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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 关于分子在表面模拟的若干问题
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zhxbaig

金虫 (小有名气)
对各个答案的一个整理
回答：
1 距离的确定一般在各自的原子半径和共价半径之间选择，越接近真实值，计算时间越短，如果超出一定限制，太远或者太近，也会发生不真实的结果。这个可以在小体系做些实验，然后再在大系统中使用。
2 还是不太确定。有老师说，直接加上就可以，软件应该会默认是CO2分子。这个暂时不太确定，再试试看。
3 都可以。优化后加入CO2，可以剩下一些运算的时间。不过有时候，体系变化太多的话，不好将CO2放在具体的吸附位置上。依据具体的体系而定。
4 一般对称性操作可以减少运算的时间。我算了下有对称性和没有对称性时候的比较，基本上没有太多的变化，除了运算时间外。（在MS中，show symmetry显示的是体系以前的对称性，所以加入CO后，需要find。当find架应用之后，再显示的话，就是新的对称性了。）
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11楼2011-09-01 16:27:58
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