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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 求助 土壤基因组 PCR 扩增问题 已有15人参与

跟很多人一样 做的是土壤微生物多样性
这里,我觉得有一个很大的瓶颈 就是提取基因组之后的PCR扩增问题。因为后面的所有分子水平的分析都建立在PCR 扩增的基础上。可是 我做了很久,这个扩增效果总是不理想。
在此发帖,希望做类似工作的 能够将自己在实验过程中的心得一一列举出来 不论什么因素 只要是自己觉得影响pCR 效果的 都列举出来吧,毕竟 经验这东西 还是很重要的 希望大家不吝赐教,我们一相互讨论。
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Axililiy

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2011-10-19 19:00:41
引用回帖:
1楼: Originally posted by 老夏853 at 2011-08-29 20:35:13:
跟很多人一样 做的是土壤微生物多样性
这里,我觉得有一个很大的瓶颈 就是提取基因组之后的PCR扩增问题。因为后面的所有分子水平的分析都建立在PCR 扩增的基础上。可是 我做了很久,这个扩增效果总是不理想。
在 ...

OMEGA的soil DNA Kit挺好用的,我以前提土壤DNA的时候就是用这个牌子的,提出来的很亮,它里面含有一种可以去除腐殖质的试剂,至于后期的PCR,有时候受抑制剂的影响,提的好的DNA不一定能P出来呢,试着稀释试试吧,其它的遵循PCR注意事项就是了!
27楼2011-10-19 13:00:26
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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

希望做这块的虫子们 都能出来交流交流
2楼2011-08-30 14:20:59
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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

就真的没有人愿意出来交流一下吗
3楼2011-08-30 19:36:40
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翰章

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
dhd997(金币+2): good 2011-08-31 07:40:41
主要是无菌操作;Tm值的确定及时间的确定,以及延伸时间的确定;可以做模板浓度梯度和Tm温度梯度,希望你实验顺利。
4楼2011-08-30 22:40:48
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