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帅帅6838

金虫 (正式写手)

[求助] 请教有机分子中O原子和H原子电荷数怎么计算,O-H键键级怎么计算!谢谢!

请先看文章,文章中第七页:where x represents the charge on the oxygen atom, y is the charge on the hydrogen atom and z is the O-H bond order.  文中没有讲x,y,z具体怎么计算,例如2-甲基丙酸(2-methyl-propanoic acid) 和环己甲酸x,y,z各自是多少?我想根据里面的公式计算pKa值,但是不知道x,y,z怎么求!谢谢!
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


zhonggao18(金币+1): 感谢回帖 2011-08-28 19:47:46
帅帅6838(金币+10): 谢谢您的指点! 2011-08-28 21:45:13
引用回帖:
3楼: Originally posted by 帅帅6838 at 2011-08-27 19:27:18:
(O与H的电荷是计算结果里就有的)是什么意思呢?具体怎么知道O和H的电荷呢?我要求的是环己甲酸C7H12O2的pka值。请问环己甲酸中O和H的电荷是-2和+1吗?谢谢!

看一点量子化学计算书或讲义,或到量子化学版搜一搜就知道了,这里分子中原子上的电荷指得是实际带的分电荷量,一般可以看作是吸引电子的能力不同而导致的,就如同讨论H键时,O原子上带的负电荷和H原子上带的正电荷大小是差不多的意思,只不过用不同的计算理论与方法计算的结果公有很大的不同,半经验法是对大分子结构进行分电荷计算较为简单的方法,针对特定的分子类型及特定的性质有较好的计算结果,其中AM1是较常用的方法之一。原子分电荷的大小在计算结果输出文件中就能查到。
4楼2011-08-28 10:14:16
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


帅帅6838(金币+2): 谢谢交流! 2011-08-27 19:24:01
zhonggao18(金币+1): 感谢回帖 2011-08-28 19:47:40
其实文献中已经提到:X是O原子上的电荷,Y是H原子上的电荷,这两者是通过半经验法的AM1方法计算得到的,Z是键级,是计算结果中O元素与H元素两者的电子密度矩阵的平方和。不知是不是这回事?具体怎么算的Z值不太清楚,但O与H的电荷是计算结果里就有的。
2楼2011-08-27 19:10:06
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帅帅6838

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yytsnake at 2011-08-27 19:10:06:
其实文献中已经提到:X是O原子上的电荷,Y是H原子上的电荷,这两者是通过半经验法的AM1方法计算得到的,Z是键级,是计算结果中O元素与H元素两者的电子密度矩阵的平方和。不知是不是这回事?具体怎么算的Z值不太清 ...

(O与H的电荷是计算结果里就有的)是什么意思呢?具体怎么知道O和H的电荷呢?我要求的是环己甲酸C7H12O2的pka值。请问环己甲酸中O和H的电荷是-2和+1吗?谢谢!
3楼2011-08-27 19:27:18
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帅帅6838

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yytsnake at 2011-08-28 10:14:16:
看一点量子化学计算书或讲义,或到量子化学版搜一搜就知道了,这里分子中原子上的电荷指得是实际带的分电荷量,一般可以看作是吸引电子的能力不同而导致的,就如同讨论H键时,O原子上带的负电荷和H原子上带的正电 ...

谢谢您!在写论文,要用到该文中的方法计算数据,今天已经查到所需要的文献数据!再次表示感谢!
5楼2011-08-28 21:46:28
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