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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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[交流] 怎样判断细菌属于哪个种?

RT
做16S rDNA同源性分析,然后NCBI比对,发现有几个种和目标菌株的同源性一样高,都超过99%,然后构建系统发育树,目标菌还是没有和其中某一个处在同一个分支,请问这种情况下再怎么做可以判断细菌属于哪个种?
有看到DNA-DNA杂交的,有人知道这个俺们?
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
tuobaohua(金币+2): 从未用过,能否指点一二?? 2011-08-16 14:42:18
去RDP II数据库判断一下就好
2楼2011-08-16 13:24:23
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
tuobaohua(金币+1): 好的,非常谢谢 2011-08-17 07:47:20
去google或者baidu上搜索RDP,关键词就是RDP,然后按照说明把16S rDNA的序列输入就可以了
3楼2011-08-16 16:00:44
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lkphg

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
tuobaohua(金币+2): 觉得生理生化试验好玄乎啊,感觉那些都没什么用,呵呵 2011-08-17 07:47:09
引用回帖:
1楼: Originally posted by tuobaohua at 2011-08-15 17:21:35:
RT
做16S rDNA同源性分析,然后NCBI比对,发现有几个种和目标菌株的同源性一样高,都超过99%,然后构建系统发育树,目标菌还是没有和其中某一个处在同一个分支,请问这种情况下再怎么做可以判断细菌属于哪个种?
...

LZ还需要结合细菌形态特征,再做个生理生化鉴定才可判断细菌属于哪个种。
4楼2011-08-16 23:32:18
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